232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1326 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 472 aa  934    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  91.31 
 
 		 472 aa  856    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  60.92 
 
 		 483 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  64.98 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  53.91 
 
 		 479 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  54.24 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  50.84 
 
 		 480 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  53.23 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  53.92 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  52.52 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  53.21 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  54.05 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  52.02 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  51.8 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  50.52 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  52.19 
 
 		 484 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  52.19 
 
 		 482 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  53.09 
 
 		 479 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  55.63 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  51.96 
 
 		 482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  51.96 
 
 		 482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  52.42 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  52.42 
 
 		 486 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  52.42 
 
 		 487 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  51.46 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  51.46 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  50.94 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  51.46 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  51.93 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  51.88 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  51.88 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  51.93 
 
 		 494 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  48.06 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  48.56 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  49.26 
 
 		 499 aa  428  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  49.32 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  47.42 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  45.26 
 
 		 527 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  42.94 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  42.94 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  42.94 
 
 		 491 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  42.22 
 
 		 490 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  41.9 
 
 		 490 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  42.11 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  42.11 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  42.42 
 
 		 489 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  42.11 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  52.04 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  42.42 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  43.35 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  43.06 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  27.33 
 
 		 537 aa  153  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  29.82 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  30.2 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  26.38 
 
 		 564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  26.48 
 
 		 555 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  25.25 
 
 		 559 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  27.8 
 
 		 539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  25.05 
 
 		 559 aa  120  7.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  25.09 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  25.56 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  24.12 
 
 		 599 aa  107  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  30.18 
 
 		 687 aa  103  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  29.41 
 
 		 686 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  30.15 
 
 		 685 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  28.49 
 
 		 686 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  28.86 
 
 		 707 aa  99.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1572  carbon starvation protein CstA  25.45 
 
 		 723 aa  97.4  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487074  normal  0.864906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  24.81 
 
 		 561 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  28.01 
 
 		 687 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  28.19 
 
 		 688 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  28.69 
 
 		 692 aa  94  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  38.85 
 
 		 585 aa  93.6  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  30.06 
 
 		 688 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  30.06 
 
 		 688 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  37.14 
 
 		 599 aa  92  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  28.78 
 
 		 691 aa  91.3  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  27.34 
 
 		 603 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  27.34 
 
 		 603 aa  91.3  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  27.57 
 
 		 688 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4635  carbon starvation protein CstA  27.81 
 
 		 688 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151575  normal  0.995482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  27.35 
 
 		 688 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3378  carbon starvation protein CstA  28.06 
 
 		 745 aa  90.1  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  27.34 
 
 		 603 aa  89.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  27.81 
 
 		 691 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  27.35 
 
 		 688 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  27.35 
 
 		 688 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  26.92 
 
 		 691 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  29.59 
 
 		 687 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1130  carbon starvation protein CstA  34.46 
 
 		 701 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.899607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  28.99 
 
 		 688 aa  87.4  5e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  35.96 
 
 		 688 aa  87.4  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  28.7 
 
 		 690 aa  86.7  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  36.43 
 
 		 691 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  26.52 
 
 		 537 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0448  carbon starvation protein CstA  40.17 
 
 		 588 aa  85.1  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000722986  hitchhiker  0.00131941 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41010  Carbon starvation protein  27.88 
 
 		 685 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.425566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  35.66 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3001  carbon starvation protein CstA  27.51 
 
 		 603 aa  84  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  22.63 
 
 		 573 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>