232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00986 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  72.82 
 
 		 486 aa  708    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  94.13 
 
 		 494 aa  936    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  72.67 
 
 		 487 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  71.69 
 
 		 478 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  998    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  72.65 
 
 		 482 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  72.65 
 
 		 482 aa  724    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  71.81 
 
 		 479 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  71.75 
 
 		 486 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  72.3 
 
 		 484 aa  723    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  73.55 
 
 		 477 aa  708    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  81.15 
 
 		 499 aa  810    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  72.73 
 
 		 478 aa  718    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  72.67 
 
 		 487 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  73.76 
 
 		 478 aa  726    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  72.95 
 
 		 482 aa  721    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  89.47 
 
 		 494 aa  897    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  74.44 
 
 		 392 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  56.8 
 
 		 527 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  56.34 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  52.65 
 
 		 479 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  55.25 
 
 		 473 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  55.25 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  53.78 
 
 		 489 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  53.01 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  54.95 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  52.39 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  51.88 
 
 		 483 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  51.63 
 
 		 484 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  52.01 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  47.86 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  47.86 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  47.86 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  47.86 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  47.86 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  50.57 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  47.15 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  46.19 
 
 		 494 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  45.94 
 
 		 489 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  46.61 
 
 		 487 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.15 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.15 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  45.94 
 
 		 490 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.15 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  45.94 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  45.94 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  51.93 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  45.94 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  45.09 
 
 		 490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  44.09 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  43.68 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  28.96 
 
 		 537 aa  167  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.11 
 
 		 555 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  30.33 
 
 		 546 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  29.2 
 
 		 554 aa  150  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.22 
 
 		 559 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  27.8 
 
 		 599 aa  143  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.46 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.82 
 
 		 559 aa  141  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  27.36 
 
 		 555 aa  137  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  27.98 
 
 		 585 aa  134  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.48 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0894  carbon starvation protein CstA  25.87 
 
 		 592 aa  125  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  26.82 
 
 		 561 aa  125  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  27.52 
 
 		 615 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  27.41 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  25.32 
 
 		 688 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  25.5 
 
 		 696 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  28.93 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  26.79 
 
 		 537 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  27.29 
 
 		 603 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  27.54 
 
 		 647 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  27.86 
 
 		 606 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  27.29 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  29.43 
 
 		 688 aa  117  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  31.61 
 
 		 692 aa  114  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  27.63 
 
 		 615 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 		 684 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  27.92 
 
 		 615 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  25.18 
 
 		 690 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  26.45 
 
 		 686 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  25.32 
 
 		 686 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  37.24 
 
 		 599 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  24.91 
 
 		 696 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 		 691 aa  111  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  24.77 
 
 		 687 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  25.09 
 
 		 707 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  26.53 
 
 		 703 aa  110  5e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  25.14 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  28.57 
 
 		 684 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  24.91 
 
 		 692 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 		 692 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  24.95 
 
 		 692 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1979  carbon starvation protein CstA  28.57 
 
 		 685 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.55888 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  25 
 
 		 692 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  25 
 
 		 692 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  25 
 
 		 692 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>