232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2399 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  73.88 
 
 		 489 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 486 aa  974    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  67.45 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  67.45 
 
 		 473 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  68.09 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  61.75 
 
 		 480 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  60.74 
 
 		 479 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  59 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  58.09 
 
 		 484 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  57.4 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  57.86 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  57.86 
 
 		 482 aa  510  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  57.86 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  57.56 
 
 		 479 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  57.63 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  57.91 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  54.58 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  56.26 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  57.63 
 
 		 486 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  57.63 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  57.63 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  56.04 
 
 		 494 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  53.01 
 
 		 494 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  53.76 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  53.23 
 
 		 499 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  54.29 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  50.29 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  51.59 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  51.58 
 
 		 483 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  51.16 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  57.14 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  50.52 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  47.06 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  46.86 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.26 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.26 
 
 		 491 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  47.06 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  46.86 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  45.9 
 
 		 487 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.18 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  46.75 
 
 		 489 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  46.67 
 
 		 490 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  46.93 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  49.58 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  49.58 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  49.58 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  49.58 
 
 		 480 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  49.58 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  47.35 
 
 		 490 aa  404  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  46.38 
 
 		 494 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  41.05 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  29.34 
 
 		 537 aa  161  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  29.18 
 
 		 554 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  28.83 
 
 		 555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.18 
 
 		 559 aa  128  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.27 
 
 		 559 aa  128  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  26.69 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  26.97 
 
 		 615 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  27.29 
 
 		 599 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  28.28 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  26.99 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  28.74 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  26.4 
 
 		 692 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  26.4 
 
 		 692 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  27.5 
 
 		 603 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  26.22 
 
 		 692 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  26.34 
 
 		 615 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.37 
 
 		 573 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  25.86 
 
 		 692 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  25.32 
 
 		 692 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  25.86 
 
 		 692 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  28.84 
 
 		 642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  26.4 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  26.4 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  26.06 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  24.59 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  24.59 
 
 		 692 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  24.16 
 
 		 707 aa  110  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  24.59 
 
 		 692 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  25.64 
 
 		 684 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  25.64 
 
 		 539 aa  108  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  27.09 
 
 		 696 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  26.56 
 
 		 615 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  25.84 
 
 		 684 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  27.7 
 
 		 696 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1263  carbon starvation protein CstA  25.23 
 
 		 690 aa  107  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  25.68 
 
 		 686 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2387  carbon starvation protein CstA  27.14 
 
 		 647 aa  107  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0259  carbon starvation protein CstA  26.44 
 
 		 681 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  25.64 
 
 		 561 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4341  carbon starvation protein CstA  26.1 
 
 		 684 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.278499  normal  0.165929 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2607  carbon starvation protein CstA  26.16 
 
 		 691 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.325051  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1596  carbon starvation protein CstA  25.95 
 
 		 567 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.083237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  26.17 
 
 		 537 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  27.32 
 
 		 687 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  29.41 
 
 		 753 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  26.49 
 
 		 606 aa  103  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0334  carbon starvation protein CstA  26.49 
 
 		 689 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  26.04 
 
 		 687 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>