232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1229 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 472 aa  942    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  84.58 
 
 		 470 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  83.86 
 
 		 473 aa  783    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  67.36 
 
 		 489 aa  621  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  68.09 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  67.02 
 
 		 467 aa  600  1e-170  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  63.6 
 
 		 480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  54.53 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  54.97 
 
 		 478 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  56.51 
 
 		 486 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  56.54 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  53.49 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  54.55 
 
 		 484 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  54.68 
 
 		 477 aa  498  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  56.4 
 
 		 479 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  54.65 
 
 		 482 aa  498  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  54.32 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  54.32 
 
 		 482 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  54.95 
 
 		 494 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  55.9 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  53.75 
 
 		 486 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  53.75 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  53.75 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  55.25 
 
 		 494 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  54.8 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  54.84 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  51.37 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 483 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  55.86 
 
 		 483 aa  461  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  53.09 
 
 		 484 aa  448  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  55.56 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.58 
 
 		 491 aa  432  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  46.88 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  46.68 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  48.5 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  46.68 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.58 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.58 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  46.68 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  46.99 
 
 		 489 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  55.61 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  46.67 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  46.04 
 
 		 490 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  49.43 
 
 		 490 aa  413  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  47.95 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  47.95 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  47.95 
 
 		 480 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  48.99 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  48.16 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  45.52 
 
 		 494 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  42.82 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  27.76 
 
 		 537 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  28.19 
 
 		 555 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  27.89 
 
 		 537 aa  130  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  29.53 
 
 		 546 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.59 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  28.42 
 
 		 539 aa  123  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  26.59 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  26.87 
 
 		 564 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  28.13 
 
 		 554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  25.86 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.69 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  26.81 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2790  carbon starvation protein CstA  27.27 
 
 		 615 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0575  carbon starvation protein A  27.38 
 
 		 642 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3542  carbon starvation protein CstA  36.88 
 
 		 585 aa  97.1  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3644  carbon starvation protein CstA  25.24 
 
 		 603 aa  95.9  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3948  carbon starvation protein CstA  25.24 
 
 		 603 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.813593  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  26.1 
 
 		 603 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0268  carbon starvation protein CstA  25.24 
 
 		 603 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2310  carbon starvation protein CstA  27.51 
 
 		 753 aa  91.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0265591  hitchhiker  0.00199124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0990  carbon starvation protein CstA  27.01 
 
 		 537 aa  89.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000027285  normal  0.0507495 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  34.23 
 
 		 599 aa  89  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  33.78 
 
 		 555 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0148  carbon starvation protein CstA  35.66 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0831  carbon starvation protein CstA  38.4 
 
 		 765 aa  83.2  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.464079 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08610  carbon starvation protein, predicted membrane protein  39.68 
 
 		 753 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0681  carbon starvation protein CstA  38.4 
 
 		 766 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0850  carbon starvation protein CstA  29.95 
 
 		 624 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  42.57 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  33.95 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1348  carbon starvation protein A  36.8 
 
 		 701 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.401846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  32.72 
 
 		 586 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3361  carbon starvation protein CstA  26.55 
 
 		 765 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2711  carbon starvation protein CstA  31.74 
 
 		 617 aa  77.8  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0894  carbon starvation protein CstA  29.44 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  36.89 
 
 		 599 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  36.29 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  34.4 
 
 		 703 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  34.4 
 
 		 703 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  36.44 
 
 		 688 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3727  carbon starvation protein CstA  34.92 
 
 		 684 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3404  carbon starvation protein CstA  34.92 
 
 		 684 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5210  carbon starvation protein CstA  37.82 
 
 		 691 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  34.4 
 
 		 703 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  29.2 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0860  carbon starvation protein CstA  33.59 
 
 		 591 aa  76.3  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.983517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  34.92 
 
 		 686 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4167  carbon starvation protein CstA  36.03 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  36.51 
 
 		 687 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>