232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3415 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  100 
 
 		 490 aa  984    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  88.02 
 
 		 490 aa  872    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  78.44 
 
 		 487 aa  787    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  92.86 
 
 		 491 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  93.06 
 
 		 491 aa  941    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  88.64 
 
 		 489 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  99.59 
 
 		 490 aa  983    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  93.27 
 
 		 491 aa  942    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  99.8 
 
 		 490 aa  984    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  99.8 
 
 		 490 aa  984    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  94.69 
 
 		 490 aa  943    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  48.2 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  47.98 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  45.55 
 
 		 484 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  47.19 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  46.86 
 
 		 486 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  45.93 
 
 		 494 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  45.38 
 
 		 479 aa  412  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  45.14 
 
 		 482 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  45.31 
 
 		 482 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  46.88 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  44.44 
 
 		 478 aa  411  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  46.2 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  45.14 
 
 		 482 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  47.01 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  46.85 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  43.65 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  45.34 
 
 		 486 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  45.49 
 
 		 477 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  44.29 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  44.65 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  44.65 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  45.94 
 
 		 494 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  44.65 
 
 		 486 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  45.81 
 
 		 484 aa  392  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  44.47 
 
 		 499 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  42.8 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  44.57 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  43.3 
 
 		 483 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  42.89 
 
 		 483 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  46.94 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  44.49 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  44.49 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  44.49 
 
 		 480 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  48.54 
 
 		 392 aa  362  9e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  44.28 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  44.28 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  44.79 
 
 		 472 aa  359  5e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  38.74 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  37.53 
 
 		 490 aa  303  5.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  34.58 
 
 		 484 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  29.44 
 
 		 537 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  26.04 
 
 		 537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  29.42 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  26.89 
 
 		 564 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  26.28 
 
 		 554 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2942  carbon starvation protein CstA  27.17 
 
 		 696 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.627155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1551  carbon starvation protein CstA  27.17 
 
 		 696 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  26.42 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  27.18 
 
 		 546 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4228  carbon starvation protein CstA  25.99 
 
 		 687 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  24.61 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  27.87 
 
 		 688 aa  114  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  27.87 
 
 		 688 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  27.87 
 
 		 688 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  27.5 
 
 		 687 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  28.14 
 
 		 690 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7759  carbon starvation protein CstA  25.04 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  25.04 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  25.04 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  28.14 
 
 		 688 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  25.04 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  25.22 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  24.87 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  25.22 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  25.22 
 
 		 692 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.46 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  26.94 
 
 		 685 aa  110  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.23 
 
 		 559 aa  110  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  26.94 
 
 		 687 aa  110  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3982  carbon starvation protein CstA  28.26 
 
 		 688 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  25.22 
 
 		 692 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  28.85 
 
 		 687 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1963  carbon starvation protein CstA  27.29 
 
 		 606 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.929114 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  24.78 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  24.64 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  26.07 
 
 		 555 aa  105  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4638  carbon starvation protein CstA  26.42 
 
 		 691 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  26.76 
 
 		 686 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  24.11 
 
 		 701 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  24.11 
 
 		 701 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  24.11 
 
 		 701 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  24.11 
 
 		 701 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  24.11 
 
 		 701 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4273  carbon starvation protein CstA  26.02 
 
 		 691 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>