232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1015 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  100 
 
 
494 aa  993    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  53.94 
 
 
480 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  53.94 
 
 
480 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  53.94 
 
 
480 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  54.58 
 
 
480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  54.58 
 
 
480 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  49.58 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  48.93 
 
 
482 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  47.62 
 
 
482 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  48.5 
 
 
484 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  47.28 
 
 
479 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  50 
 
 
486 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  49.32 
 
 
478 aa  418  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  46.3 
 
 
482 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  45.96 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  45.96 
 
 
483 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  46.47 
 
 
472 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  48.05 
 
 
486 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  48.05 
 
 
487 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  48.82 
 
 
477 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  48.05 
 
 
487 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  48.63 
 
 
478 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  45.6 
 
 
499 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  48.19 
 
 
478 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  46.19 
 
 
494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  46.1 
 
 
480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  44.87 
 
 
494 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  45.44 
 
 
494 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  43.4 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  48.06 
 
 
472 aa  397  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  51.65 
 
 
392 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 
486 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  43.16 
 
 
484 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  46.77 
 
 
470 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  46.67 
 
 
473 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  44.3 
 
 
489 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  45.52 
 
 
472 aa  360  4e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  42.13 
 
 
484 aa  340  5e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  40.95 
 
 
490 aa  337  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  42.92 
 
 
467 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  40.61 
 
 
490 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  39.91 
 
 
489 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  38.74 
 
 
490 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  38.74 
 
 
490 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  38.74 
 
 
490 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  38.74 
 
 
490 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  39.58 
 
 
491 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  39.58 
 
 
491 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  39.58 
 
 
491 aa  330  4e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  38.53 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  38.88 
 
 
487 aa  316  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2230  carbon starvation protein CstA  26.84 
 
 
555 aa  133  6.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000106566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  26.95 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  27.31 
 
 
554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  26.32 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  26.9 
 
 
559 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  25.54 
 
 
555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  26.42 
 
 
573 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  28.7 
 
 
564 aa  113  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27.13 
 
 
561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  26.85 
 
 
599 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  30 
 
 
688 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  25.95 
 
 
585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0995  carbon starvation protein A  29.33 
 
 
703 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2696  carbon starvation protein CstA  25.48 
 
 
615 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0097  carbon starvation protein CstA  26.59 
 
 
692 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.457953 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0897  carbon starvation protein A  29.03 
 
 
703 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000953526  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4884  carbon starvation protein CstA  26.59 
 
 
692 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393748  normal  0.287345 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0924  carbon starvation protein A  29.03 
 
 
703 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000573812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  30.36 
 
 
685 aa  107  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3574  carbon starvation protein CstA  26.69 
 
 
691 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5434  carbon starvation protein CstA  26.41 
 
 
692 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  29.41 
 
 
707 aa  106  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5298  carbon starvation protein CstA  26.96 
 
 
692 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.884841  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4710  carbon starvation protein CstA  26.96 
 
 
692 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5561  carbon starvation protein CstA  26.96 
 
 
692 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528361  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  30.21 
 
 
687 aa  106  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0072  carbon starvation protein A  29.53 
 
 
692 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.702943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3417  carbon starvation protein CstA  26.67 
 
 
690 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1025  putative carbon starvation A transmembrane protein  26.15 
 
 
688 aa  104  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2252  carbon starvation protein A  26.23 
 
 
692 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  29.41 
 
 
546 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  28.78 
 
 
688 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2451  carbon starvation protein CstA  28.65 
 
 
686 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.397179  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  28.78 
 
 
688 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6471  carbon starvation protein CstA  25.87 
 
 
692 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.333661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  29.94 
 
 
687 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1294  carbon starvation protein A  26.05 
 
 
692 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.712641  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3065  carbon starvation protein CstA  26.05 
 
 
692 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2939  carbon starvation protein CstA  26.05 
 
 
692 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3580  carbon starvation protein CstA  24.76 
 
 
615 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.863613  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07540  carbon starvation protein, predicted membrane protein  38.16 
 
 
599 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.620318  normal  0.553558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3245  carbon starvation protein CstA  28.27 
 
 
692 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255181  normal  0.357407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0022  carbon starvation A transmembrane protein  27.94 
 
 
686 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0699392  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  28.19 
 
 
701 aa  101  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>