232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4235 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4235  carbon starvation protein CstA  100 
 
 
480 aa  943    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2354  carbon starvation protein CstA  64.44 
 
 
473 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.322622  normal  0.0377797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2353  carbon starvation protein CstA  63.28 
 
 
470 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4761  normal  0.0387762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0227  carbon starvation protein A, putative  63.56 
 
 
489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1229  carbon starvation protein CstA  63.6 
 
 
472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0438651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2399  carbon starvation protein CstA  61.75 
 
 
486 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2330  carbon starvation protein CstA  58.53 
 
 
478 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0840034  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0218  putative carbon starvation protein A  55.85 
 
 
494 aa  520  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.737228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2884  carbon starvation protein CstA  57.24 
 
 
478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00820008  hitchhiker  0.00000000141998 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1764  carbon starvation protein CstA  56.16 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.468167  hitchhiker  0.00720784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2595  carbon starvation protein CstA  56.83 
 
 
484 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147178  hitchhiker  0.00215078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1478  carbon starvation protein CstA  55.51 
 
 
479 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2433  carbon starvation protein CstA  56.67 
 
 
482 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0181801  hitchhiker  0.00240517 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2503  carbon starvation protein CstA  56.67 
 
 
482 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.068155  normal  0.0168974 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1547  carbon starvation protein CstA  56.46 
 
 
482 aa  511  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.115845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2435  carbon starvation protein CstA  57.17 
 
 
486 aa  511  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.338097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00986  hypothetical protein  56.34 
 
 
494 aa  511  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1226  carbon starvation protein CstA  59.73 
 
 
467 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2956  carbon starvation protein CstA  54.73 
 
 
479 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.029089  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3340  carbon starvation protein CstA  55.99 
 
 
499 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.724244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1280  carbon starvation protein  55.44 
 
 
477 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.513544  hitchhiker  0.00159846 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004412  carbon starvation protein A  55.6 
 
 
494 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1657  carbon starvation protein CstA  56.46 
 
 
486 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0002875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2686  carbon starvation protein CstA  56.46 
 
 
487 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  hitchhiker  0.000480532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1694  carbon starvation protein CstA  56.46 
 
 
487 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000103268  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0348  carbon starvation protein A  50.68 
 
 
527 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0741  carbon starvation protein CstA  51.86 
 
 
483 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.230376  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0725  carbon starvation protein CstA  51.86 
 
 
483 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1325  carbon starvation protein CstA  51.72 
 
 
472 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0012  carbon starvation protein CstA, putative  53.26 
 
 
484 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823.1  carbon starvation protein A  58.52 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1326  carbon starvation protein CstA  53.79 
 
 
472 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1687  carbon starvation protein A  48.55 
 
 
480 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1822  carbon starvation protein A  48.55 
 
 
480 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1867  putative carbon starvation protein A  48.55 
 
 
480 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0679400000000002e-34 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1667  carbon starvation protein A  48.34 
 
 
480 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.267258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1944  putative carbon starvation protein A  48.34 
 
 
480 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00862817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0772  carbon starvation protein CstA  46.71 
 
 
489 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3490  carbon starvation protein CstA  46.64 
 
 
490 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3613  carbon starvation protein CstA  46.64 
 
 
490 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3415  carbon starvation protein CstA  46.85 
 
 
490 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1109  cold-shock regulated carbon starvation protein A  47.59 
 
 
487 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0874  carbon starvation protein CstA  46.64 
 
 
490 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.390469  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0951  carbon starvation protein CstA  46.38 
 
 
490 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0924305  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1015  carbon starvation protein CstA, putative  46.1 
 
 
494 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00237627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3047  carbon starvation protein CstA  46.22 
 
 
491 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000178589  normal  0.0660711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0925  carbon starvation protein CstA  46.22 
 
 
491 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0439371  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0888  carbon starvation protein CstA  46.22 
 
 
491 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228832  normal  0.272877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0907  carbon starvation protein CstA  45.8 
 
 
490 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.695183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3022  carbon starvation protein CstA  46.22 
 
 
490 aa  415  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.939377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0605  carbon starvation protein CstA  43.12 
 
 
484 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000190307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1546  carbon starvation protein CstA  29.64 
 
 
537 aa  152  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000304878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1295  carbon starvation protein CstA  27.47 
 
 
559 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1123  carbon starvation protein A  27.66 
 
 
559 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15869  normal  0.492518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1445  carbon starvation-induced protein  28.57 
 
 
537 aa  136  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.126725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1208  carbon starvation protein CstA  27.13 
 
 
555 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1389  carbon starvation-induced protein  29.24 
 
 
599 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3028  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 
701 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0649  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0618  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3046  carbon starvation protein CstA  26.25 
 
 
701 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0683  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.720109  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0618  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0712  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0319605  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0696  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0379562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0653  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0758  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.544793  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0639  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0500  carbon starvation protein A  26.25 
 
 
701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10430  carbon starvation protein CstA  29.26 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000165578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03070  carbon starvation protein, predicted membrane protein  27.81 
 
 
573 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2003  carbon starvation protein CstA  26.88 
 
 
585 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.120083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2361  carbon starvation protein CstA  25.86 
 
 
687 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.13571  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0613  carbon starvation protein CstA  28.32 
 
 
539 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000204279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0314  carbon starvation protein CstA  26.05 
 
 
586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326681  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2633  carbon starvation protein CstA  26.21 
 
 
687 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1905  carbon starvation protein CstA  27.07 
 
 
688 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2017  carbon starvation protein CstA  27.07 
 
 
688 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.121466  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1227  carbon starvation protein CstA  26.11 
 
 
603 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.454995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0897  carbon starvation protein CstA  27.49 
 
 
589 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1399  carbon starvation protein CstA  27.27 
 
 
695 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2243  carbon starvation protein CstA  26.9 
 
 
688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0770165 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1741  carbon starvation protein CstA  27.24 
 
 
688 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4534  carbon starvation protein CstA  24.74 
 
 
686 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0845129  normal  0.908498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4191  carbon starvation protein CstA  25.57 
 
 
688 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.421404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2191  carbon starvation protein CstA  26.09 
 
 
590 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0113  carbon starvation protein CstA  27.08 
 
 
564 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.885531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2942  carbon starvation protein CstA  25.22 
 
 
687 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727344  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0909  carbon starvation protein CstA  28.11 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000299613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2639  carbon starvation protein CstA  26.49 
 
 
685 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00455809 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1186  carbon starvation protein CstA  25.6 
 
 
707 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0310498  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03566  Carbon starvation regulatory protein  27 
 
 
561 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1708  carbon starvation protein CstA  26.47 
 
 
690 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.727328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4883  carbon starvation protein CstA  25.17 
 
 
688 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0798  carbon starvation protein CstA  25.94 
 
 
688 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999684  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5246  hypothetical protein  25.04 
 
 
688 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60950  hypothetical protein  25.22 
 
 
688 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3960  carbon starvation protein CstA  25.92 
 
 
613 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0153587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4641  carbon starvation protein CstA  25.52 
 
 
688 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4503  carbon starvation protein CstA  25.52 
 
 
688 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818376  normal  0.614972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>