More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1126 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  91.26 
 
 		 183 aa  347  6e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  50.58 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  50 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  38.71 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  36.84 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  33.87 
 
 		 185 aa  99  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  31.72 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  30.05 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  34.41 
 
 		 185 aa  85.5  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  33.83 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  30.16 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  29.87 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 491 aa  65.5  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  39.18 
 
 		 584 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 		 584 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  34.69 
 
 		 560 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 589 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  35.29 
 
 		 656 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 656 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  38.18 
 
 		 1230 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 776 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.46 
 
 		 363 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  35.24 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  49.18 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 652 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 798 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0758  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 800 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 757 aa  55.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 586 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 655 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 1519 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 758 aa  55.5  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  34.74 
 
 		 468 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42670  Sensory histidine protein kinase CbrA  34.23 
 
 		 981 aa  55.1  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2586  sensor histidine kinase  50 
 
 		 623 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.209829  normal  0.69032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 481 aa  54.7  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 395 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35 
 
 		 433 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.16 
 
 		 546 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 655 aa  54.3  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 540 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 585 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572324  normal  0.76853 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 456 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 449 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6389  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 688 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3010  histidine kinase  33.66 
 
 		 537 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.335446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 650 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  35.35 
 
 		 394 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 		 762 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2543  sensor histidine kinase  32.99 
 
 		 460 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35 
 
 		 475 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 457 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  38.75 
 
 		 457 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4694  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 991 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000630671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  32.26 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50990  Nitrogen fixation regulatory protein, NifL  31.73 
 
 		 519 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  31.18 
 
 		 420 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.11 
 
 		 1234 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3208  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 702 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.289512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 680 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3161  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.46 
 
 		 681 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2444  histidine kinase  38.24 
 
 		 559 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 589 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  40.85 
 
 		 424 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 452 aa  52.4  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 		 583 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  32.17 
 
 		 550 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.96 
 
 		 755 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2300  flagellar regulatory protein B  32.32 
 
 		 357 aa  52.4  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4190  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.9 
 
 		 842 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0491  signal transduction histidine kinase-like protein  35.29 
 
 		 617 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.146334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 535 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2505  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 707 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 591 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2417  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 480 aa  52  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 711 aa  52  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5915  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 786 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.91558 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 760 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 362 aa  52  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 394 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 525 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 1126 aa  51.6  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 525 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2304  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.43 
 
 		 679 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 803 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 		 1651 aa  51.6  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3301  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 674 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.808009  normal  0.64014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 		 1016 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0083  two-component sensor protein  33.73 
 
 		 458 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  36 
 
 		 469 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 598 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  32.53 
 
 		 457 aa  51.2  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0080  two-component sensor protein  33.73 
 
 		 458 aa  51.6  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 557 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4133  two-component sensor protein  33.73 
 
 		 458 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000603711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>