More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0545 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  41.62 
 
 
185 aa  153  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  36.81 
 
 
188 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  35.52 
 
 
183 aa  142  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  36.72 
 
 
181 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  39.01 
 
 
188 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  35.16 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  32.98 
 
 
184 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  32.97 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  41.22 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  33.87 
 
 
183 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  33.87 
 
 
183 aa  99  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  42.62 
 
 
176 aa  94  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
661 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
403 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
452 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  40.86 
 
 
452 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6445  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.72 
 
 
830 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0224728  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  36.84 
 
 
402 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.3 
 
 
426 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
662 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
412 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  41.94 
 
 
522 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 
858 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  35.85 
 
 
548 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.88 
 
 
864 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.06 
 
 
661 aa  55.1  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  44.83 
 
 
463 aa  54.7  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
457 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0123  PAS sensor protein  48.39 
 
 
692 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5761  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.33 
 
 
708 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0752  ATPase domain-containing protein  48.39 
 
 
537 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
488 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.308567 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
620 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
591 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  38.16 
 
 
559 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 
688 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  36.56 
 
 
552 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2333  histidine kinase  26.52 
 
 
538 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
1089 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.04 
 
 
553 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
767 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
725 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  38.61 
 
 
701 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0680  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
728 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
592 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
494 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  40 
 
 
544 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0146  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 
1381 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.436687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01426  histidine kinase  46.67 
 
 
507 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643455  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1137  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000022686  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1417  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
767 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000575152  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  46.88 
 
 
760 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  29.6 
 
 
587 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  32.65 
 
 
517 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  36.9 
 
 
590 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
589 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
599 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4846  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.61 
 
 
701 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.110474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
570 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.59 
 
 
827 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
548 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 
686 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.07 
 
 
834 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  33.33 
 
 
498 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2463  sporulation kinase B  32.63 
 
 
422 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.956719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  31.58 
 
 
422 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
990 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2644  sporulation kinase B  32.63 
 
 
422 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.364917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
589 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2661  sporulation kinase B  31.58 
 
 
422 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107303 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.9 
 
 
416 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  30.91 
 
 
567 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
574 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.932152  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
457 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  33.65 
 
 
490 aa  52  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.39 
 
 
1050 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.51 
 
 
957 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 
548 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  30.08 
 
 
1885 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0878  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.67 
 
 
754 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0285  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.65 
 
 
411 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
721 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
620 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.838333  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.77 
 
 
573 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1182 aa  51.6  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0403  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
374 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 
551 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3696  sensory box histidine kinase/response regulator  43.55 
 
 
827 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.652711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1778  PAS  43.55 
 
 
956 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.584017  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1796  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.74 
 
 
451 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.323222  normal  0.540644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 
503 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
1103 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  45.16 
 
 
1092 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1300  PAS  45.16 
 
 
695 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.233563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.16 
 
 
977 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  40.91 
 
 
539 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0607  sensor histidine kinase  44 
 
 
539 aa  51.2  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>