More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0339 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  50 
 
 		 188 aa  190  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  38.46 
 
 		 183 aa  144  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  40.34 
 
 		 181 aa  140  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  40.54 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  37.08 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  39.01 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  38.86 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  39.89 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  33.12 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  33.9 
 
 		 179 aa  87  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  33.83 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  39.17 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 589 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 589 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2251  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 		 721 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0770498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  31.31 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 905 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1392  sporulation kinase B  30.48 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3951  sporulation kinase B  31.43 
 
 		 402 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  29.81 
 
 		 321 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  34.07 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 655 aa  55.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  36.36 
 
 		 654 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1027  histidine kinase  33.68 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 588 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0474386 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.04 
 
 		 356 aa  55.1  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5111  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 589 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 1358 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1455  sporulation kinase B  28.16 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.693151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1256  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1229  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1231  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  29.52 
 
 		 587 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 360 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1356  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1495  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0591081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2976  histidine kinase  33.66 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  31.87 
 
 		 461 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1429  sporulation kinase B  29.52 
 
 		 402 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000732404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 574 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.932152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 360 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 632 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  31.31 
 
 		 360 aa  53.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  32.61 
 
 		 608 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 390 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 356 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 441 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 403 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 576 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 653 aa  52.4  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  33.7 
 
 		 975 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 609 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0657  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 618 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 570 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 360 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 360 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1255  histidine kinase  27.18 
 
 		 402 aa  51.6  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 420 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 680 aa  51.6  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1363 aa  51.6  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 564 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4780  histidine kinase  30.84 
 
 		 742 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  37.14 
 
 		 349 aa  51.2  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 776 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 661 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 817 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 362 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5204  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 969 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.299525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 461 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 370 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  30.19 
 
 		 611 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 		 791 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  27.04 
 
 		 858 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  35.71 
 
 		 462 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3564  histidine kinase  34.29 
 
 		 544 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0842  sensory box histidine kinase/response regulator  40 
 
 		 787 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  31.63 
 
 		 423 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2896  sensory box histidine kinase/response regulator  37.14 
 
 		 534 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  30.11 
 
 		 622 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  28.57 
 
 		 452 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2051  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.442026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 1021 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 371 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.31 
 
 		 417 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 452 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 594 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.36 
 
 		 490 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 453 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1581  histidine kinase  40.58 
 
 		 541 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 423 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  31.63 
 
 		 423 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  29.59 
 
 		 481 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 611 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 985 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>