More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2141 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  100 
 
 
181 aa  358  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  48.02 
 
 
178 aa  171  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  47.7 
 
 
185 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  44.32 
 
 
188 aa  156  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  47.16 
 
 
185 aa  155  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  39.77 
 
 
184 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  40.34 
 
 
188 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  36.36 
 
 
183 aa  137  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  36.72 
 
 
185 aa  136  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  41.29 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  38.71 
 
 
183 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  43.44 
 
 
179 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  36.88 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  31.43 
 
 
402 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 
655 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  34.29 
 
 
654 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0794  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
460 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00933158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3910  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
850 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.302032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.01 
 
 
363 aa  58.9  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
412 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
488 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.308567 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  31.73 
 
 
581 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.54 
 
 
574 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.932152  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  32.91 
 
 
516 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  30.59 
 
 
423 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  32 
 
 
1710 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
510 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
403 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  31.63 
 
 
571 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2978  PAS  34.85 
 
 
424 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.317341  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
452 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  29.9 
 
 
452 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
457 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
484 aa  55.1  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
661 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3526  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
584 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  33.33 
 
 
611 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  31.18 
 
 
351 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  33.68 
 
 
552 aa  54.7  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  32.58 
 
 
461 aa  54.7  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
827 aa  54.7  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
678 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  34.07 
 
 
412 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  29.9 
 
 
525 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.91 
 
 
541 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
389 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
844 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
390 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  37.66 
 
 
544 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
557 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
683 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002812  flagellar sensor histidine kinase FleS  30.11 
 
 
343 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
632 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
691 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  33.33 
 
 
357 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
898 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  38.27 
 
 
943 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  30.93 
 
 
791 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  30.93 
 
 
791 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0764  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.68 
 
 
568 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
628 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3624  ATPase domain-containing protein  30.21 
 
 
344 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0197283  normal  0.342036 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
477 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
632 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  31.82 
 
 
429 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 
520 aa  52.8  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0299  putative nitrogen regulation protein NtrY  31.03 
 
 
714 aa  52.4  0.000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.333561  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 
776 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.31 
 
 
645 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
593 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
593 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  37.04 
 
 
632 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  34.09 
 
 
530 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03165  hypothetical protein  29.03 
 
 
345 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 
834 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
680 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
522 aa  52.4  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1908  histidine kinase  40.98 
 
 
772 aa  52  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0199543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  34.09 
 
 
531 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
448 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.19 
 
 
548 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
390 aa  52  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
412 aa  52  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  33.68 
 
 
308 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
384 aa  52  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
631 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
576 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  33.66 
 
 
614 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0423  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.59 
 
 
498 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
588 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
570 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45 
 
 
651 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.57 
 
 
458 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0024  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
390 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.114696  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  29.21 
 
 
458 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  29.21 
 
 
458 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1027  histidine kinase  29.67 
 
 
322 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
422 aa  51.2  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  34.13 
 
 
595 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
707 aa  51.2  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000535893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>