More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0917 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  100 
 
 
178 aa  353  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  48.02 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  40.91 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  40.68 
 
 
185 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  39.77 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  39.43 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  38.51 
 
 
185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  38.86 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  32.97 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  37.66 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  36.84 
 
 
183 aa  101  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  35.47 
 
 
179 aa  96.7  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  34.91 
 
 
176 aa  94.7  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
557 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1523  histidine kinase  32.29 
 
 
437 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  34.34 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
588 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  34.34 
 
 
371 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
434 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 
390 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 
844 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
659 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
462 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  36.08 
 
 
584 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
403 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  35.58 
 
 
462 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  35 
 
 
774 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  35.96 
 
 
402 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  32.56 
 
 
516 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  30.1 
 
 
310 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
494 aa  63.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
491 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
488 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.308567 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
682 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
713 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  32.08 
 
 
610 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  31.86 
 
 
517 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
393 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3697  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
405 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
467 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
570 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 
586 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  34.34 
 
 
552 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  34.26 
 
 
591 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  34.02 
 
 
560 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  33.98 
 
 
525 aa  62.4  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
589 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  35.71 
 
 
363 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
544 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.73 
 
 
490 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 
446 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
570 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1396  sensor histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 
1092 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0361  histidine kinase  34.69 
 
 
468 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000148321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2781  histidine kinase  30.7 
 
 
321 aa  62  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
553 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
498 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.67 
 
 
490 aa  61.6  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
408 aa  61.2  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
622 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
356 aa  61.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.38 
 
 
363 aa  61.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  40.3 
 
 
622 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3933  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
589 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.78 
 
 
1148 aa  61.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.3 
 
 
622 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2229  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
925 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.843602  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  31.63 
 
 
420 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  31.13 
 
 
647 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  31.68 
 
 
614 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
610 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0007  multi-sensor signal transduction histidine kinase, putative  30.93 
 
 
450 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
661 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  35.24 
 
 
560 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  37.76 
 
 
611 aa  60.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
591 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
488 aa  60.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
508 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  35.05 
 
 
305 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
441 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0285  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
411 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.695529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
591 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  35 
 
 
587 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
576 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1306  PAS sensor Signal tranduction histidine kinase  36.9 
 
 
949 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
630 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
360 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30.97 
 
 
1427 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
607 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2797  sensor kinase of Zn/Pb responsive two-component regulatory system  32.11 
 
 
707 aa  59.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000203115  normal  0.0370017 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2655  sporulation kinase B  32.29 
 
 
419 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  hitchhiker  0.000000573688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2304  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
460 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.757006  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50990  Nitrogen fixation regulatory protein, NifL  30.77 
 
 
519 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
360 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
514 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4673  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
713 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>