More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0915 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  56.32 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  50.58 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  49.42 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  34.91 
 
 		 178 aa  94.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  42.62 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  31.98 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  33.53 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  36.88 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  36.08 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  39.17 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  33.11 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  29.59 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 473 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 524 aa  57.8  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05292  histidine kinase  34.69 
 
 		 428 aa  57  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 776 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0085  putative sensor histidine kinase  39.53 
 
 		 835 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.376568 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1103  histidine kinase  31.78 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  35.16 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  36.9 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  31.87 
 
 		 420 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3075  histidine kinase  36.26 
 
 		 550 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 493 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 557 aa  55.5  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  31.63 
 
 		 453 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 584 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 466 aa  54.7  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  42.25 
 
 		 457 aa  54.7  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 652 aa  54.7  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 502 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 613 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 565 aa  54.3  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  36.08 
 
 		 1230 aa  54.3  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1419  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.74 
 
 		 831 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  31 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  31 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 830 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 614 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 476 aa  53.9  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  31 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 340 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 458 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  35.71 
 
 		 340 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 571 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 478 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 1154 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 454 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 463 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3401  histidine kinase  33.64 
 
 		 361 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.810153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 466 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  34.69 
 
 		 567 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 465 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 564 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 337 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 340 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  35.24 
 
 		 340 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  34.29 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 		 436 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 603 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6238  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 		 737 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.438492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 601 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 601 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 428 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2618  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 436 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.252609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 498 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.988505  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 843 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 589 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 535 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 640 aa  52  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4524  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 		 589 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 449 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  33.33 
 
 		 584 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 1484 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 458 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 548 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2675  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 798 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 337 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5610  histidine kinase  34.74 
 
 		 344 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4899  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 607 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435235  normal  0.0631454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  25.71 
 
 		 458 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  34.31 
 
 		 340 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0869  histidine kinase  44.44 
 
 		 413 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0007  multi-sensor signal transduction histidine kinase, putative  34.69 
 
 		 450 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5108  two-component sensor  34.74 
 
 		 564 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3253  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 545 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 620 aa  51.2  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  33.66 
 
 		 551 aa  51.2  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 840 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0315  putative sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>