More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0097 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  100 
 
 
183 aa  379  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  40.91 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  38.8 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  38.46 
 
 
188 aa  145  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  38.46 
 
 
188 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  35.52 
 
 
185 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  36.36 
 
 
181 aa  137  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  37.14 
 
 
185 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  35.56 
 
 
184 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  31.17 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  29.87 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  33.11 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  29.48 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
452 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  35.58 
 
 
452 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
360 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  34.02 
 
 
360 aa  59.3  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  35.56 
 
 
402 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
360 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
360 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
814 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
360 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 
457 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
360 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4467  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
589 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0773722  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
360 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
360 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  34.69 
 
 
429 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
360 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3113  histidine kinase  38 
 
 
654 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000907022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3689  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
655 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
403 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1894  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1085 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1253  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.01 
 
 
638 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
488 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  35.51 
 
 
343 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  35.51 
 
 
343 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
830 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0705844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
661 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1365  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.86 
 
 
567 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2383  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.68 
 
 
484 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
458 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.464381  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4448  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
589 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
371 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3777  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
701 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.215477  hitchhiker  0.0067097 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2975  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.79 
 
 
663 aa  53.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658614  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
799 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  32.29 
 
 
418 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.44 
 
 
356 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
362 aa  52  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0721  histidine kinase  32.69 
 
 
675 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
448 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1019  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
858 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0833425  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
421 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3878  histidine kinase  34.62 
 
 
692 aa  51.6  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.245936  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.79 
 
 
571 aa  51.6  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3443  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
801 aa  51.2  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2474  histidine kinase  42.67 
 
 
559 aa  51.6  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.369133 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0607  sensor histidine kinase  37.63 
 
 
539 aa  51.6  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
370 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1027  histidine kinase  34.04 
 
 
322 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155612  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
758 aa  50.8  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
595 aa  50.8  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4312  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
591 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3303  histidine kinase  34.09 
 
 
449 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36420  putative sensor/response regulator hybrid  31.53 
 
 
699 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426849  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3125  putative sensor/response regulator hybrid  32.41 
 
 
650 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.70953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
830 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.919247  hitchhiker  0.00131243 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
421 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
449 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.749105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  31.58 
 
 
382 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  25.96 
 
 
464 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  42.03 
 
 
756 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 
851 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
611 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  33.71 
 
 
461 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0558  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.11 
 
 
431 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 
851 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 
653 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
685 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
779 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
905 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
591 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
884 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
659 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3498  two component sensor kinase  30.43 
 
 
1125 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1427  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
776 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1715  sensor histidine kinase  28.44 
 
 
517 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.443764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1483  sensor-kinase  33.96 
 
 
582 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  0.317682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  24.76 
 
 
464 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 
783 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0576  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
507 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  30.28 
 
 
851 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002812  flagellar sensor histidine kinase FleS  31.33 
 
 
343 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
1124 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  32.97 
 
 
829 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1785  sensor-kinase  33.02 
 
 
582 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>