More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0008 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
421 aa  858    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  42.47 
 
 
417 aa  331  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
424 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
430 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  42.48 
 
 
414 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  40.14 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.63 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
417 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
420 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  44.23 
 
 
422 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  44.63 
 
 
422 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  37.11 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
418 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
418 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.59 
 
 
450 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  40.54 
 
 
419 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 
419 aa  266  7e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  40.29 
 
 
419 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
419 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  37.97 
 
 
426 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  37.97 
 
 
426 aa  239  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
446 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  37.74 
 
 
426 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  34.56 
 
 
443 aa  237  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  35.28 
 
 
447 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  35.37 
 
 
465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
472 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555946  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 
436 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
434 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3111  histidine kinase  37.97 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.344952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3090  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 
467 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
468 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
436 aa  225  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 
468 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  33.9 
 
 
450 aa  223  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  32.46 
 
 
451 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
449 aa  206  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.49 
 
 
448 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
459 aa  203  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  32.11 
 
 
429 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  34.14 
 
 
433 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  33.41 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  31.87 
 
 
449 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  32.27 
 
 
436 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
448 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
457 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  33.25 
 
 
452 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  30.92 
 
 
442 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4818  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
422 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.904783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
452 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
415 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.112978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
444 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2148  two-component system, sensor protein  31.72 
 
 
405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.113962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.0681596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3187  sensor histidine kinase  33.88 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 
435 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 
465 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  28.1 
 
 
449 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00798  two-component system sensor protein  31.63 
 
 
408 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.170926  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
442 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  32.29 
 
 
463 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
463 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  29.66 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4070  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
444 aa  153  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  29.02 
 
 
442 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
433 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
462 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4173  sensor histidine kinase  30.35 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0133  sensor histidine kinase  28.94 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
461 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
464 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0338625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
440 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1835  histidine kinase  31.21 
 
 
459 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3530  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
429 aa  146  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0552  histidine kinase  29.6 
 
 
440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0128  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
430 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00320906  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3708  ATPase domain-containing protein  30.45 
 
 
429 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1843  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
457 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.87984  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0606  histidine kinase  29.15 
 
 
464 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0907998  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0595  ATPase domain-containing protein  29.15 
 
 
464 aa  143  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
430 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>