More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3451 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
384 aa  791    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  41.69 
 
 
402 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2000  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.58 
 
 
411 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
403 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2828  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
409 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.453157  normal  0.0182492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2192  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
442 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3697  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
405 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.194004  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50200  two-component sensor  42.48 
 
 
402 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.5 
 
 
356 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3460  flagellar sensor histidine kinase FleS  40.84 
 
 
404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3933  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
405 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  39.26 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 
356 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1955  sensor histidine kinase FleS  41.58 
 
 
368 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
405 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
405 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 
371 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  36.55 
 
 
398 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02892  putative sensory box sensor histidine kinase in two-component regulatory system  39.08 
 
 
380 aa  233  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  39.38 
 
 
431 aa  232  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03165  hypothetical protein  37.88 
 
 
345 aa  232  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
360 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002812  flagellar sensor histidine kinase FleS  39.22 
 
 
343 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
360 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
360 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
360 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
360 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2311  histidine kinase  37.15 
 
 
347 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.61 
 
 
360 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
360 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  40.68 
 
 
360 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3069  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
371 aa  219  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
360 aa  218  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2300  flagellar regulatory protein B  38.62 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  36.91 
 
 
343 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
390 aa  192  8e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  36.28 
 
 
343 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  32.45 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
564 aa  142  8e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.36 
 
 
579 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
581 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
722 aa  123  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.69 
 
 
611 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.38 
 
 
598 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.03 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
422 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.03 
 
 
608 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.03 
 
 
608 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.33 
 
 
608 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.03 
 
 
608 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.14 
 
 
491 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  26.74 
 
 
608 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
673 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 
738 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  25 
 
 
604 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 
604 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.78 
 
 
351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0979  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.69 
 
 
617 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2643  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2655  sporulation kinase B  28.51 
 
 
419 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.346759  hitchhiker  0.000000573688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
970 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.69 
 
 
621 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
586 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  27.8 
 
 
830 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  31.35 
 
 
613 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  29.33 
 
 
420 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  29.33 
 
 
420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0923  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
621 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
438 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
661 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.2 
 
 
510 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
615 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2669  sporulation kinase B  28.09 
 
 
389 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  29.33 
 
 
423 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.22 
 
 
744 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 
393 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2391  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
573 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000390402  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
595 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
748 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  28.89 
 
 
423 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2712  sporulation kinase B  28.63 
 
 
422 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  28.21 
 
 
422 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2387  sporulation kinase B  28.21 
 
 
422 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102161  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  29.44 
 
 
617 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
469 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.02 
 
 
417 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.48 
 
 
679 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1495  sporulation kinase B  28.81 
 
 
402 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0591081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  30.04 
 
 
656 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1513  sensor histidine kinase  28 
 
 
423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
656 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1392  sporulation kinase B  28.81 
 
 
402 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.48 
 
 
679 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.7 
 
 
416 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3951  sporulation kinase B  28.39 
 
 
402 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.14171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>