More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5544 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5544  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  827    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2206  histidine kinase  45.22 
 
 		 429 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.979834  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2344  histidine kinase  46.04 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.349621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1606  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0150845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2035  putative photosynthetic apparatus regulatory protein regB  33.58 
 
 		 450 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4051  histidine kinase  34.31 
 
 		 465 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0322  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0381069 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2270  histidine kinase  33.33 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2780  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.892917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0600  ATP-binding region, ATPase-like  32.38 
 
 		 449 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0237  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.349779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2977  sensor histidine kinase  30.72 
 
 		 449 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3136  sensor histidine kinase  29.1 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0506729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1827  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000139866  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2735  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.503254  hitchhiker  0.00000000176943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2201  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.298182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0008  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7659  histidine kinase  29.11 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4062  histidine kinase  31.99 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.081892  normal  0.353238 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100518  normal  0.877828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1520  sensor histidine kinase PrrB (RegB)  31.29 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 448 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.755695  normal  0.0681596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 444 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  0.0755864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289635  decreased coverage  0.00139676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1835  histidine kinase  33.88 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0230  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.615813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1739  two-component sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 462 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0602735 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1642  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 479 aa  162  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2689  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 419 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0930  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 418 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0887  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0338625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2864  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 441 aa  155  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0537405  normal  0.483733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 440 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3432  sensor histidine kinase RegB  31.39 
 
 		 463 aa  155  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0110  histidine kinase  29.44 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0152985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0606  histidine kinase  33.81 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0907998  normal  0.131642 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1586  sensor histidine kinase  31.37 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0595  ATPase domain-containing protein  33.81 
 
 		 464 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.0445222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12550  periplasmic sensory histidine protein kinase  32.14 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.418352  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2840  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 465 aa  153  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.916749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4231  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4554  sensor histidine kinase  32.21 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58320  putative two-component sensor  32.55 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4318  histidine kinase  28.64 
 
 		 442 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0183324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0820  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 420 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.197209  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0359  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5108  putative two-component sensor  32.81 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0064  two component sensor kinase  30.26 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0665  histidine kinase  32.79 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 466 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0133  sensor histidine kinase  30 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0128  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00320906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3894  histidine kinase  30.83 
 
 		 442 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203447  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0173  sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00702706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0162  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 426 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0188  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3389  histidine kinase  27.66 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3251  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0383  sensor kinase protein  31.04 
 
 		 426 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.326302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2913  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3435  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0719781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0198  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2176  sensor histidine kinase  31.04 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2881  putative two-component sensor  25.78 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0738997  hitchhiker  0.00159828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4042  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0039  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.37 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4060  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 474 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3712  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0136  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4383  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  34.14 
 
 		 986 aa  116  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.54 
 
 		 654 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  36.36 
 
 		 490 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 630 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 468 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.541426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3141  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 468 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2480  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00569401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3094  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0688371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>