More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1145 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1145  response regulator receiver protein  100 
 
 		 417 aa  831    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0913  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.19 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.27 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1636  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.87 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.26 
 
 		 450 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.26 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0596  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.76 
 
 		 474 aa  110  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000817529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  25.43 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 121 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2158  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 120 aa  77.8  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6560  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.646619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 121 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  34.45 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  34.45 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  36.13 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  36.13 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  31.9 
 
 		 121 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2100  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 120 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  33.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.83 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3337  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 121 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2780  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 121 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.5 
 
 		 1418 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.72 
 
 		 217 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.67 
 
 		 1866 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0893  winged helix family two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 233 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3135  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 1187 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  32.2 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  30.3 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  30 
 
 		 125 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0855  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0781  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.174075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  29.84 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01871  two-component response regulator  27.87 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 122 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1537  two component LuxR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  28.35 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  27.5 
 
 		 124 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02441  two-component response regulator  28.95 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.72299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 721 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 1431 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.33 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 123 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  31.93 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.55 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.23 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.23 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.74 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2392  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0321511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  27.5 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0314  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 259 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.645458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  27.98 
 
 		 238 aa  69.3  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 125 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0472  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 133 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.418097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 130 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.04 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4992  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 121 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  27.64 
 
 		 128 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  33.33 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  28.35 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4866  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 133 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.638507  normal  0.0288736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 120 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>