More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0913 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0913  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  100 
 
 		 435 aa  880    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1145  response regulator receiver protein  40.73 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0261  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.75 
 
 		 463 aa  276  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.3078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0596  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.93 
 
 		 474 aa  166  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000817529  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1636  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.96 
 
 		 465 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0782  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000969424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 450 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000908772  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1874  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.420153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 121 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3747  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 121 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 122 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3248  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 121 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3018  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 123 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.04 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  31.4 
 
 		 1989 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  34.51 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0508  response regulator receiver domain-containing protein  32.43 
 
 		 121 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.481314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3990  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 146 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27172  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0356  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 121 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0780111  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  32.8 
 
 		 125 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  34.82 
 
 		 1866 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.21 
 
 		 1960 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2551  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  27.5 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4952  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 121 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.699568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  34.26 
 
 		 1029 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0751  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 121 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0489  response regulator receiver  34.51 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.646514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3898  response regulator receiver  34.21 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 2022 aa  74.7  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  35.14 
 
 		 764 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  21.81 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.54 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02637  regulatory protein PilH family  31.93 
 
 		 128 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2399  response regulator receiver protein  28.33 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.732485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 121 aa  73.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  33.94 
 
 		 769 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  33.61 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0873  response regulator receiver domain-containing protein  31.2 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0633299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  32.77 
 
 		 2336 aa  73.6  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1724  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 128 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.999633  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.43 
 
 		 231 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1789  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 128 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 121 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.41 
 
 		 1956 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3240  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.26 
 
 		 229 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1474  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.11 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 707 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3768  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 120 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48045  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0918  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  23.83 
 
 		 460 aa  71.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  33.06 
 
 		 2092 aa  71.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 1758 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 1907 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0922  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 777 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  21.91 
 
 		 454 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00781234  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 801 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0509  twitching motility protein PilH  33.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05330  twitching motility protein PilH  33.04 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  27.89 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1038  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  31.9 
 
 		 2048 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  20.25 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3661  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 120 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0930  response regulator receiver protein  35.44 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.139996  normal  0.100238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  33.03 
 
 		 1079 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 121 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1002 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3051  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 122 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3968  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 1832 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  29.87 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2107  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  32.52 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>