More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3051 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3051  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  40 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  38.33 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  41.18 
 
 		 123 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 120 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  39.29 
 
 		 126 aa  97.8  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  43.7 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00031  chemotaxis response regulator  42.24 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  42.86 
 
 		 121 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 125 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1409  putative chemotaxis response regulator transcription regulator protein  40.16 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2248  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.426629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2365  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00457125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2097  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.371893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4159  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4047  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 137 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.772934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5599  response regulator receiver  37.5 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.833931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  39.5 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  39.62 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  39.17 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  38.14 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  40.35 
 
 		 121 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  36.13 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  36.44 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  36.44 
 
 		 121 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  36.13 
 
 		 119 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  35.29 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  35.34 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  38.79 
 
 		 120 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  36.97 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40.5 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 120 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1139  response regulator receiver  39.66 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  35.14 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1107  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.91502 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2443  putative chemotaxis response regulator, CheY5  38.6 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0297  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.127858  normal  0.448356 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1787  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0329  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  34.68 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 1691 aa  77.8  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  33.9 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  31.93 
 
 		 121 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  33.61 
 
 		 2048 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 1180 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1853  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.955028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>