More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0680 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  68.61 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  53.76 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  53.38 
 
 		 281 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  54.28 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.43 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  47.96 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  47.64 
 
 		 293 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  45.82 
 
 		 348 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  45.09 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  47.94 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 		 441 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.95 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  43.18 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  40.34 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  49.44 
 
 		 484 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  43.32 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 292 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  41.44 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  37.42 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  43.45 
 
 		 352 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  39.93 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  39.06 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.91 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  36.27 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  44.36 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  40.28 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  39.41 
 
 		 278 aa  144  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  30.63 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 		 280 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  29.32 
 
 		 343 aa  125  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 		 286 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  29.39 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 275 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.57 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  52.94 
 
 		 291 aa  114  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  48.97 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.15 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  36.98 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.43 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.87 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  50.86 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  34.95 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  44.65 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  35.51 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  39.88 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  43.84 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.41 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 242 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  35.33 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.39 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  52.21 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  39.25 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  38.03 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 208 aa  100  3e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  36.41 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 260 aa  99.8  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  42 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  48.46 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  42.47 
 
 		 272 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 287 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  43.71 
 
 		 276 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2032  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 		 273 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 		 274 aa  99.4  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 		 262 aa  99.4  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.74 
 
 		 307 aa  99.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 273 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>