More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1234 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 441 aa  846    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  77.23 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  53.67 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  53.11 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  51.85 
 
 		 293 aa  235  9e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  48.13 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  48.86 
 
 		 284 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  52.03 
 
 		 277 aa  217  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.43 
 
 		 368 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  46.64 
 
 		 289 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  48.15 
 
 		 281 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  49.62 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  47.57 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  50.19 
 
 		 287 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  47.16 
 
 		 290 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 292 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 		 306 aa  202  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 280 aa  200  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  44.66 
 
 		 308 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  45.72 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  45.15 
 
 		 281 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  44.73 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  44.73 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.31 
 
 		 403 aa  192  8e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  44.73 
 
 		 284 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  42.7 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  45.79 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  37.13 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  40.89 
 
 		 297 aa  186  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  45.39 
 
 		 301 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  44.72 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  45.1 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  42.8 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.72 
 
 		 328 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 		 475 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 		 274 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  29.64 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  40.89 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 280 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  48.1 
 
 		 268 aa  106  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  38.53 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  45.76 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.53 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.88 
 
 		 282 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  42.55 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.91 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  45.99 
 
 		 280 aa  103  8e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  103  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  51.22 
 
 		 268 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 281 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.48 
 
 		 285 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 280 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.18 
 
 		 285 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  37.74 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  35.42 
 
 		 272 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 293 aa  99.8  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  42.42 
 
 		 303 aa  99.8  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 233 aa  99  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 286 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  28.29 
 
 		 275 aa  99  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  37.24 
 
 		 342 aa  99  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  39.75 
 
 		 285 aa  97.8  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 		 282 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  39.49 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 285 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  39.49 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  39.49 
 
 		 282 aa  97.1  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 		 267 aa  97.1  6e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 281 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 		 271 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 		 267 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 		 267 aa  96.3  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 285 aa  95.5  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 259 aa  95.1  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 		 310 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 285 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  36.82 
 
 		 296 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 285 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 236 aa  94.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 271 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 266 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 274 aa  94  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 280 aa  94  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>