More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0242 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 311 aa  607  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  70.53 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  51.88 
 
 		 281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 276 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  47.78 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 		 290 aa  232  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 292 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  46.82 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 348 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.29 
 
 		 284 aa  206  5e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 284 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 		 441 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  47.57 
 
 		 484 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  37.42 
 
 		 322 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  44.36 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  35.85 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  36.79 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  39.77 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 		 403 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  44.15 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  39.29 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  36.4 
 
 		 278 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  29.69 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  28.08 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  58.12 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 475 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  35.08 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  32.11 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  32.16 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  35.07 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  33.05 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  37.67 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  27.71 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 260 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  38.51 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  35.54 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  37.84 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  37.58 
 
 		 285 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.23 
 
 		 280 aa  99.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  29.71 
 
 		 277 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  41.22 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 271 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.16 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.16 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  37.16 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  37.16 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  37.16 
 
 		 285 aa  99.4  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.15 
 
 		 281 aa  99  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 280 aa  99  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>