More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0805 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
343 aa  693    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  55.59 
 
 
328 aa  363  3e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  33.44 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  33.55 
 
 
339 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  31.66 
 
 
308 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  32.65 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  32.73 
 
 
301 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  31.21 
 
 
292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  30.62 
 
 
289 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  31.67 
 
 
297 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
368 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  29.35 
 
 
311 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
292 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  32.29 
 
 
403 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  32.8 
 
 
302 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 
280 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  32.89 
 
 
441 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  34.25 
 
 
291 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 
276 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
284 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  30.71 
 
 
284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  30.23 
 
 
293 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 
260 aa  116  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  31.45 
 
 
277 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  29.32 
 
 
308 aa  109  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  27 
 
 
306 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  31.83 
 
 
277 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
278 aa  106  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  38.37 
 
 
272 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  29.33 
 
 
281 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
267 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.73 
 
 
264 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 
279 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  30.87 
 
 
313 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
261 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  32.89 
 
 
484 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  26.8 
 
 
296 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
279 aa  99.8  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 
259 aa  99.4  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  29.35 
 
 
352 aa  99.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  38.18 
 
 
246 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 
280 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
256 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
318 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 
284 aa  95.9  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 
291 aa  96.3  8e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 
280 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  39.31 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  37.74 
 
 
278 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 
281 aa  94  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  28.05 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
261 aa  92.8  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
254 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 
266 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  26.37 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.22 
 
 
282 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.24 
 
 
475 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  47.15 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 
280 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 
268 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  32.04 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
275 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  37.67 
 
 
252 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
260 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 
260 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  45.13 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
269 aa  90.5  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  44.06 
 
 
280 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.97 
 
 
264 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  42.31 
 
 
264 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.36 
 
 
233 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  43.9 
 
 
285 aa  89.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
260 aa  89.4  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.09 
 
 
285 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
319 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>