More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1488 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
280 aa  527  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  64.5 
 
 
289 aa  337  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  63.57 
 
 
284 aa  322  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  57.72 
 
 
302 aa  258  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2503  Phosphatidate cytidylyltransferase  58.12 
 
 
403 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal  0.5122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1419  phosphatidate cytidylyltransferase  52.43 
 
 
287 aa  228  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.437057  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.84 
 
 
368 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  50.19 
 
 
441 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  46.49 
 
 
293 aa  222  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  47.43 
 
 
348 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  44.57 
 
 
281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  49.45 
 
 
301 aa  212  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  46.44 
 
 
276 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  50.91 
 
 
484 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  44.61 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  45.62 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 
290 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  41.97 
 
 
292 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  42.49 
 
 
297 aa  191  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0242  phosphatidate cytidylyltransferase  44.15 
 
 
311 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
277 aa  188  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
352 aa  188  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 
322 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  45.08 
 
 
281 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  38.27 
 
 
306 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
292 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 
284 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 
284 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 
284 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0680  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 
308 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.520441  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.25 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  36.14 
 
 
306 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  43.17 
 
 
278 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 
343 aa  142  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.83 
 
 
328 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1538  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.367129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.4 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  41.82 
 
 
303 aa  108  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
287 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
269 aa  107  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
286 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
275 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
280 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  32.53 
 
 
287 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
281 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  35.32 
 
 
341 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
268 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.4 
 
 
272 aa  105  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  44.7 
 
 
282 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
293 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  45.7 
 
 
274 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  51.26 
 
 
272 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  34.41 
 
 
301 aa  104  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.62 
 
 
267 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
267 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
342 aa  103  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  28.25 
 
 
258 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 
276 aa  102  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
267 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
284 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 
269 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
268 aa  101  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  31.02 
 
 
264 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
242 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 
280 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  46.31 
 
 
271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
280 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  43.21 
 
 
262 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
233 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
318 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
279 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.35 
 
 
282 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.97 
 
 
475 aa  100  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  37.76 
 
 
285 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.81 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  41.24 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
278 aa  99  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 
310 aa  99  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
269 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
260 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
285 aa  99  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35.37 
 
 
260 aa  99  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 
260 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  52.03 
 
 
269 aa  99  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  32.08 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>