More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1558 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  44.91 
 
 
287 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 
287 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  47.89 
 
 
283 aa  238  8e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 
285 aa  237  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 
285 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  44.21 
 
 
285 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  44.56 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  44.21 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
285 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  44.41 
 
 
285 aa  232  6e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
280 aa  229  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.41 
 
 
285 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.36 
 
 
285 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  45.94 
 
 
271 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  45.42 
 
 
279 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  45.42 
 
 
280 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  44.06 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  45.23 
 
 
271 aa  224  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.99 
 
 
285 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  46.53 
 
 
285 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  43.34 
 
 
282 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  43.34 
 
 
282 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.7 
 
 
285 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  43.34 
 
 
282 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  41.4 
 
 
285 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  46.23 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  46.23 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  46.23 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  46.23 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  46.23 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  48.11 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.36 
 
 
285 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
290 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
285 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  45.36 
 
 
282 aa  215  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  44.17 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 
287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
254 aa  208  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.4 
 
 
256 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  41 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17120  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  41.64 
 
 
271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  49.21 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  41.32 
 
 
284 aa  196  3e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
281 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  42.35 
 
 
271 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  41.64 
 
 
271 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  41.64 
 
 
271 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3048  phosphatidate cytidylyltransferase  42.2 
 
 
271 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.43758  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
271 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  39.79 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  39.65 
 
 
267 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 
268 aa  166  4e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 
272 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  39.46 
 
 
276 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
276 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  42.36 
 
 
278 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 
272 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
273 aa  145  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
272 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  37.06 
 
 
284 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  34.56 
 
 
276 aa  144  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0325  phosphatidate cytidylyltransferase  36.71 
 
 
284 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
275 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 
265 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 
275 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  54.33 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  36.1 
 
 
270 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  37.62 
 
 
273 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0662  phosphatidate cytidylyltransferase  37.76 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  32.66 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  31.9 
 
 
271 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
264 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  35.4 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
263 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1333  phosphatidate cytidylyltransferase  34.68 
 
 
273 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.844271  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
260 aa  123  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
281 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>