More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10900 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  59.21 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  53.45 
 
 		 280 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 		 341 aa  209  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.83 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.32 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.96 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 		 281 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  34.2 
 
 		 281 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.33 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  33.97 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.36 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.67 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  31.76 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  38.86 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  34.4 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.85 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 		 475 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  47.06 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.98 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 270 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.65 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  30.96 
 
 		 277 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  45.99 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  37.24 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  49.59 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.9 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  47.41 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.9 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.9 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.5 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  43.22 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  36.45 
 
 		 352 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.240801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  47.41 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  27.46 
 
 		 306 aa  105  9e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  43.22 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.22 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.22 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.22 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  34.98 
 
 		 712 aa  104  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  45.87 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  47.29 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 		 368 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  44.92 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  48.82 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 		 267 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  44.53 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.09 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.86 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 		 269 aa  102  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  30.12 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  32.52 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.58 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>