More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2623 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 264 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.8 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  36.67 
 
 		 280 aa  135  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  48.7 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.18 
 
 		 261 aa  125  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  35.09 
 
 		 310 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.52 
 
 		 211 aa  121  9.999999999999999e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  39.42 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  37.79 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  32.64 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.3 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 296 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.11 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  48.98 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.72 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.34 
 
 		 263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  33.97 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  38.22 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2591  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.163491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.06 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  30.34 
 
 		 263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  36.46 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  30.15 
 
 		 208 aa  109  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  37.35 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  33.07 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  31.72 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.42 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  37.23 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  32.55 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 		 260 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  34.07 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  37.11 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  35.5 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  30.6 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.1 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.19 
 
 		 267 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 282 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  40.77 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  41.6 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  41.14 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.35 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0119  phosphatidate cytidylyltransferase  39.63 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  38.22 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  33.33 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.94 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.16 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  37.65 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.91 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  35.53 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.15 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>