More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0354 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
267 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  94.76 
 
 
267 aa  517  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  95.13 
 
 
267 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  35 
 
 
280 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40.28 
 
 
279 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
271 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 
282 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
280 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
233 aa  130  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.61 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  30.45 
 
 
295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  34.03 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 
278 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  39.33 
 
 
265 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  36.15 
 
 
264 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  42.04 
 
 
262 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 
262 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  29.27 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  45.58 
 
 
281 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
242 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  29.97 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 
475 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 
277 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
267 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
264 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
263 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.31 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.9 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  43.62 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.8 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  34.18 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
260 aa  113  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  32.64 
 
 
288 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 
211 aa  113  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 
255 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
263 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  41.06 
 
 
280 aa  112  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  35.53 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
263 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.35 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.68 
 
 
261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  29.88 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  36.98 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  30.3 
 
 
364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.83 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
271 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  37.93 
 
 
286 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
256 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  32.28 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  32.32 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
208 aa  109  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
263 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.1 
 
 
306 aa  109  6e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
263 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 
263 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  31.1 
 
 
301 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  32.97 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.33 
 
 
265 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
280 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  31.69 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  40.69 
 
 
342 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.63 
 
 
282 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  31.95 
 
 
336 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 
272 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  39.72 
 
 
216 aa  107  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  46.72 
 
 
264 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.8 
 
 
285 aa  107  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  42.46 
 
 
348 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.13 
 
 
269 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>