More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0592 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
306 aa  580  1e-164  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  46.73 
 
 
306 aa  251  9.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 
275 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 
263 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
264 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
263 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 
296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.65 
 
 
261 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  30.3 
 
 
269 aa  116  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  27.07 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 
273 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  35.44 
 
 
260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
260 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
260 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  30 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  30 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  30 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
262 aa  112  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  29.47 
 
 
260 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  35.58 
 
 
285 aa  112  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  30.61 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  29.84 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
263 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  35.67 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 
272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  36.06 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  36.06 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
265 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
263 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  28.99 
 
 
281 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  44.51 
 
 
255 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  30.1 
 
 
267 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.55 
 
 
285 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  30.56 
 
 
285 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.45 
 
 
285 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  29.37 
 
 
267 aa  108  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  27.96 
 
 
310 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  38.07 
 
 
270 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.51 
 
 
278 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40.52 
 
 
246 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  36.95 
 
 
285 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
281 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.89 
 
 
264 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  29.15 
 
 
341 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  29.28 
 
 
475 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  28.85 
 
 
285 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  26.47 
 
 
273 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  37.14 
 
 
270 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
275 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
287 aa  105  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.68 
 
 
267 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  34.95 
 
 
264 aa  105  9e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  27.46 
 
 
303 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
264 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  27.92 
 
 
274 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.5 
 
 
284 aa  105  1e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 
233 aa  104  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
295 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  28.34 
 
 
271 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  43.54 
 
 
270 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  30.1 
 
 
267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
295 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  29.75 
 
 
280 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 
273 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  33.86 
 
 
274 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 
293 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  33.44 
 
 
259 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 
261 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
262 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
283 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.77 
 
 
266 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  35.76 
 
 
280 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
284 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
252 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  39.29 
 
 
284 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  44.22 
 
 
269 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  27.1 
 
 
279 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  33.64 
 
 
265 aa  101  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  31 
 
 
263 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  28.43 
 
 
284 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>