More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1385 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  71.38 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  74.67 
 
 		 288 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  60.34 
 
 		 295 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  60.34 
 
 		 295 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  61.94 
 
 		 294 aa  325  8.000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  52.11 
 
 		 285 aa  302  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  54.58 
 
 		 285 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  53.17 
 
 		 285 aa  291  8e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  53.17 
 
 		 285 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  43 
 
 		 290 aa  229  6e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  45.03 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  44.9 
 
 		 293 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  36.55 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  32.34 
 
 		 574 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.1 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.21 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  35.85 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.01 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  27.61 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 		 262 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.71 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  45.22 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 		 260 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  31.32 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  30.5 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  47.73 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 		 242 aa  103  5e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.02 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  40.99 
 
 		 283 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3987  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 		 348 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  39.56 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.82 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.03 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  47.27 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  30.22 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  29.37 
 
 		 267 aa  99.8  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 211 aa  99.4  7e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 		 336 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  27.74 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 		 273 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  28.98 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  38.07 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 298 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  44.2 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  28.62 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  44.92 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 271 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 		 289 aa  96.7  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 		 208 aa  95.9  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 		 339 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 267 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  27.21 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  35.83 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.89 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  49.09 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000797314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>