More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0245 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  100 
 
 
264 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  68.56 
 
 
264 aa  372  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  55.22 
 
 
267 aa  248  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
263 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
263 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 
264 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  46.82 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  47.74 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  43.98 
 
 
261 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
263 aa  214  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  45.28 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  45.28 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
263 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
263 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
263 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  45.42 
 
 
260 aa  206  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
265 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  45.63 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  39.26 
 
 
263 aa  170  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
275 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  37.15 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
285 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  32.26 
 
 
285 aa  123  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 
296 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.92 
 
 
282 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.92 
 
 
282 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.92 
 
 
282 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  45.74 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  48.44 
 
 
256 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.15 
 
 
282 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.74 
 
 
285 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 
280 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  46.46 
 
 
285 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.25 
 
 
260 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  45.67 
 
 
249 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  49.24 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.18 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  45.67 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.88 
 
 
285 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.88 
 
 
285 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.88 
 
 
285 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.88 
 
 
285 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  45.52 
 
 
282 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 
260 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.88 
 
 
285 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  33.92 
 
 
296 aa  112  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  46.88 
 
 
284 aa  112  7.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  31.45 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  45.13 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
262 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 
341 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
309 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
309 aa  109  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
309 aa  109  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  42.57 
 
 
268 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
287 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
290 aa  107  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
268 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 
211 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
306 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  48.84 
 
 
275 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 
269 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
273 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  46.27 
 
 
280 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
286 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
208 aa  106  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  45.6 
 
 
282 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  45.26 
 
 
279 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  30.37 
 
 
271 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
269 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  48.25 
 
 
298 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
267 aa  106  5e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 
298 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
280 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>