More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1288 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  99.35 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  99.35 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  57.53 
 
 		 318 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  53.4 
 
 		 313 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.22 
 
 		 307 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  56.61 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  56.61 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  56.61 
 
 		 298 aa  309  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  56.61 
 
 		 298 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  56.27 
 
 		 298 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  55.59 
 
 		 298 aa  298  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  54.97 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  54.65 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.75 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  43.61 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  43.49 
 
 		 317 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.05 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.67 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.05 
 
 		 311 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  45.18 
 
 		 314 aa  222  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 313 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  36.86 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.33 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  37.16 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  29.77 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  31.05 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  33.66 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.45 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  43.9 
 
 		 216 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 		 211 aa  107  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40.79 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40.79 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40.79 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  32.2 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.13 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 		 262 aa  100  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.02 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 		 275 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  47.32 
 
 		 260 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  29 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.58 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  33.33 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  45.67 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.38 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35.94 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  44.26 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 		 261 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.72 
 
 		 267 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  45.87 
 
 		 208 aa  97.1  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.65 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.82 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  35.19 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 293 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  39.49 
 
 		 290 aa  95.5  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  44.29 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  39.61 
 
 		 285 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  37.2 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  43.9 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 		 205 aa  95.5  1e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  44.25 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  39.57 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  42.37 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.85 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  35.2 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>