More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2519 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 280 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  54.51 
 
 		 276 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  57.54 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  55.23 
 
 		 276 aa  240  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 		 270 aa  161  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  41.37 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  45.35 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  38.29 
 
 		 282 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  38.4 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  41.18 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  41.63 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  38.77 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  42.4 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 		 273 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  51.77 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.93 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  52.71 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  52.5 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  34.25 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 		 294 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.47 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  47.24 
 
 		 264 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  43.79 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  36.72 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  32.27 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  43.26 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  50.77 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  34.98 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  34.21 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  45.52 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  45.32 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  43.04 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  32.8 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  32.8 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  33.98 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  38.54 
 
 		 233 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.07 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  46.56 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  41.96 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  43.57 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  35.41 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  30.32 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  31.52 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.57 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  46.09 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  32.62 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  47.06 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>