More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0710 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
341 aa  689    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
310 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  45.11 
 
 
303 aa  209  5e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  39.61 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  33.21 
 
 
269 aa  139  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 
296 aa  134  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  50.41 
 
 
282 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  49.14 
 
 
284 aa  124  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
281 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 
306 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  51.72 
 
 
282 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  51.72 
 
 
282 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  51.72 
 
 
282 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 
280 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 
271 aa  123  5e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.68 
 
 
269 aa  122  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  31.64 
 
 
259 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 
270 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.53 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  46.53 
 
 
281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  50 
 
 
285 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  35.91 
 
 
260 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  37.37 
 
 
280 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
285 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
278 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.5 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  49.56 
 
 
285 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.94 
 
 
252 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  48.33 
 
 
285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  52.14 
 
 
268 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  47.79 
 
 
249 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  47.79 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  51.2 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
276 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  36.26 
 
 
288 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 
322 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 
281 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.68 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  52.17 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  52.17 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.65 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  41.21 
 
 
267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  52.14 
 
 
278 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  46.62 
 
 
276 aa  110  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 
233 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 
271 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
246 aa  109  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  33.98 
 
 
264 aa  109  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  49.57 
 
 
271 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
275 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  40.76 
 
 
265 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 
261 aa  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 
289 aa  109  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32.22 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
260 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
269 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  33.66 
 
 
306 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.44 
 
 
267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.9 
 
 
284 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
261 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 
268 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
441 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 
276 aa  106  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  29.15 
 
 
306 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 
277 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  32.44 
 
 
267 aa  105  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 
271 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  41.57 
 
 
277 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
258 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  43.44 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0790  phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 
268 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.203528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  45.54 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
270 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  32.14 
 
 
290 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  41.06 
 
 
280 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 
279 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  40.6 
 
 
270 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
268 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.72 
 
 
272 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.54 
 
 
269 aa  104  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
342 aa  104  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>