More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0394 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 288 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  68.14 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  61.72 
 
 		 290 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  68.14 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  64 
 
 		 304 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  62.46 
 
 		 332 aa  351  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  61.86 
 
 		 293 aa  350  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  62.76 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  50.52 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  48.62 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  44.1 
 
 		 285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 		 285 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.79 
 
 		 285 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.2 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 		 294 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 288 aa  214  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  36.81 
 
 		 574 aa  166  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  34.58 
 
 		 364 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.32 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.71 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.45 
 
 		 281 aa  132  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  37.15 
 
 		 262 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.63 
 
 		 341 aa  125  9e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  34.28 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 264 aa  123  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  45.71 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  51.2 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  31.45 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  33.22 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  29.97 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.24 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  36.79 
 
 		 280 aa  116  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.08 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  49.62 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  34.49 
 
 		 273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  54.92 
 
 		 261 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  43.06 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  29.62 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  31.76 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  30.24 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 233 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  29.97 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  33.22 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  29.62 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  42.94 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  33.9 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  27.76 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  28.27 
 
 		 306 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  31.51 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 		 280 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  42.96 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  53.57 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 281 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  43.65 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  30.58 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  30.42 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  48.61 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.07 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.6 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  47.58 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  46.32 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>