More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11911 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
285 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  94.74 
 
 
285 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  94.39 
 
 
285 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  80 
 
 
285 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  57.04 
 
 
295 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  57.04 
 
 
295 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1385  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.11 
 
 
301 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.681736  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09871  phosphatidate cytidylyltransferase  53.07 
 
 
304 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1623  putative phosphatidate cytidylyltransferase  51.5 
 
 
288 aa  266  2e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.942257  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11011  phosphatidate cytidylyltransferase  53.12 
 
 
294 aa  262  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.223077 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.02 
 
 
290 aa  241  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  43.92 
 
 
332 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 
304 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 
295 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.93 
 
 
295 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  34.36 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47250  predicted protein  32.44 
 
 
574 aa  132  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  32.99 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 
280 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
263 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  45.39 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  47.79 
 
 
256 aa  113  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  44.03 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 
263 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.43 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  47.22 
 
 
242 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
268 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  32.51 
 
 
255 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 
264 aa  107  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  32.34 
 
 
269 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.66 
 
 
211 aa  107  3e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
285 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  41.92 
 
 
280 aa  106  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  31.27 
 
 
261 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 
286 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
271 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
254 aa  105  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  51.22 
 
 
216 aa  105  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 
262 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 
285 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
253 aa  105  9e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  36.11 
 
 
285 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  49.18 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  35.65 
 
 
285 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  33.87 
 
 
282 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  30.53 
 
 
282 aa  104  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
254 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 
266 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 
475 aa  103  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  40.14 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
241 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
274 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
241 aa  103  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.68 
 
 
264 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0209  phosphatidate cytidylyltransferase  48.28 
 
 
247 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.809934  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
271 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
271 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  46.15 
 
 
285 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 
275 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  46.22 
 
 
241 aa  102  7e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
278 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  31.38 
 
 
280 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
254 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 
306 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
277 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.31 
 
 
285 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  30.77 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.24 
 
 
284 aa  101  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
279 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 
276 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
260 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
271 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  38.12 
 
 
285 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  35.62 
 
 
289 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
309 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
309 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  45.24 
 
 
309 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.36 
 
 
368 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
285 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
287 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 
277 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  45.95 
 
 
275 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  33.16 
 
 
284 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>