More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3840 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
318 aa  632  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  59.27 
 
 
313 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  57.53 
 
 
309 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  57.19 
 
 
309 aa  351  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  57.19 
 
 
309 aa  351  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  52.27 
 
 
307 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  57.56 
 
 
313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 
311 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  48.33 
 
 
298 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  47.67 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  47.67 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  47.67 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  47.7 
 
 
298 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  47 
 
 
298 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  41.78 
 
 
310 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  40.2 
 
 
310 aa  230  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 
313 aa  229  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  40.82 
 
 
309 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 
298 aa  225  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  44.49 
 
 
314 aa  225  9e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.84 
 
 
310 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
309 aa  222  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.12 
 
 
309 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.47 
 
 
310 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
309 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
309 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  39.94 
 
 
318 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.35 
 
 
311 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
309 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
312 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 
309 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  33.78 
 
 
316 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 
334 aa  161  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  33.01 
 
 
329 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  28.29 
 
 
326 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  31.31 
 
 
324 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  49.21 
 
 
256 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
246 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
280 aa  113  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  34.5 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  33.89 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  41.91 
 
 
284 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
280 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
282 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
282 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.62 
 
 
282 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
265 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.75 
 
 
264 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44.8 
 
 
249 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  34.17 
 
 
267 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.09 
 
 
280 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  44.8 
 
 
285 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 
285 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
279 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  46.83 
 
 
283 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 
285 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  49.55 
 
 
267 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 
242 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  41.13 
 
 
282 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  46.46 
 
 
275 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  49.12 
 
 
295 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  49.12 
 
 
295 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 
290 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.48 
 
 
296 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
319 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
261 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 
252 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 
293 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.8 
 
 
264 aa  102  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
285 aa  102  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  37.56 
 
 
261 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
290 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 
266 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 
271 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>