122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0931 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 329 aa  658    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  71.43 
 
 		 326 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  66.47 
 
 		 334 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  58.15 
 
 		 324 aa  341  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  42.5 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.99 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.69 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  40.57 
 
 		 311 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 		 310 aa  239  6.999999999999999e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.07 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 309 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  41.23 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  44.15 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  33.01 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  32.48 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  31.43 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  28.8 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  32.58 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  32.58 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  31.2 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  30.56 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  25.19 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  25.31 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  27.21 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  31.58 
 
 		 280 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  27.21 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  27.21 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  31.19 
 
 		 285 aa  53.1  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  25.31 
 
 		 285 aa  52.8  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  28.83 
 
 		 282 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  27.94 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  30.65 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  27.69 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  29.46 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  24.43 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  30.16 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  27.59 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  26.57 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  29.29 
 
 		 242 aa  48.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  28.83 
 
 		 280 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  26.57 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  26.98 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  25.56 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  28.68 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 241 aa  46.2  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  30.16 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  26.43 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  26.43 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  27.05 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  35.38 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  40.79 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  27.73 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  28.71 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  28.71 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  28.71 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  28.71 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  28.71 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  27.88 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  28.26 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  27.72 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  23.26 
 
 		 249 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  22.58 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  26.47 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  25.54 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>