More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0890 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 309 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  99.68 
 
 		 309 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  95.15 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  94.82 
 
 		 309 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  96.76 
 
 		 309 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 310 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  52.82 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.07 
 
 		 311 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  52.98 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  56.11 
 
 		 313 aa  328  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.07 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  52.79 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  53.16 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  53.44 
 
 		 318 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  52.81 
 
 		 331 aa  316  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  51.94 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 		 298 aa  305  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 310 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  53.98 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  52.65 
 
 		 314 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  48.14 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  44.97 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  38.49 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  40.29 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.2 
 
 		 307 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  36.54 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  38.87 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  37.54 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  37.05 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  36.72 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  36.72 
 
 		 298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  36.21 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  32.37 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 265 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 265 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  48.67 
 
 		 282 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 		 285 aa  95.9  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 296 aa  95.9  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 263 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  46.96 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1107  phosphatidate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 236 aa  94.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  41.8 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  36.31 
 
 		 259 aa  93.2  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  40.41 
 
 		 263 aa  92.4  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  27.67 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  46.55 
 
 		 280 aa  92.4  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 233 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 		 339 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  43.09 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  42.19 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  40.3 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  35.1 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  39.85 
 
 		 285 aa  89.4  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.42 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 		 280 aa  89  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  43.09 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 		 475 aa  88.6  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  34.91 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  41.3 
 
 		 290 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.02 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  38.81 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  40 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.28 
 
 		 260 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 280 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  42.28 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  40.71 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  39.72 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 		 283 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>