More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1449 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
284 aa  544  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.620583  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  38.6 
 
 
282 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  38.6 
 
 
282 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  38.6 
 
 
282 aa  132  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.6 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  38.35 
 
 
267 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 
274 aa  126  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  43.37 
 
 
283 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  37.36 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  37.71 
 
 
279 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
280 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  35.36 
 
 
287 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  39.55 
 
 
284 aa  122  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  50.35 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  36.12 
 
 
271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  51.68 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  41.76 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  34.76 
 
 
280 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01378  phosphatidate cytidylyltransferase  36.1 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  35.52 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  49.63 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  37.26 
 
 
268 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  41.08 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  34.06 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  48.73 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  41.81 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
268 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  38.72 
 
 
276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  42.39 
 
 
285 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.41 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.85 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.41 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  41.85 
 
 
285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.41 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.41 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.41 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1461  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.152404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  34.4 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  36.78 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
287 aa  113  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  47.47 
 
 
269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  48.09 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
271 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  38.78 
 
 
271 aa  112  9e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  34.04 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  35.87 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  35.69 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  35.75 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  43.4 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  44.59 
 
 
271 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1260  phosphatidate cytidylyltransferase  45.81 
 
 
278 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.655167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  34.93 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0813  phosphatidate cytidylyltransferase  37.84 
 
 
273 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  37.18 
 
 
264 aa  109  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
285 aa  109  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
256 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  43.15 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  38.06 
 
 
281 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
254 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
261 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 
271 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  35.64 
 
 
272 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
241 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  38.11 
 
 
271 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  38.69 
 
 
242 aa  107  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  48.39 
 
 
241 aa  107  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  43.65 
 
 
279 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  38.75 
 
 
281 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 
264 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.93 
 
 
265 aa  106  4e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1409  phosphatidate cytidylyltransferase transmembrane protein  49.67 
 
 
271 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0568  phosphatidate cytidylyltransferase  36.92 
 
 
267 aa  106  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.562699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  32.98 
 
 
285 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  43.24 
 
 
276 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 
285 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
281 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  36.47 
 
 
273 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
241 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 
284 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1165  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 
271 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2250  phosphatidate cytidylyltransferase  38.99 
 
 
254 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.427821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1449  phosphatidate cytidylyltransferase  35.63 
 
 
271 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  42.44 
 
 
284 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 
271 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  36.7 
 
 
272 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>