198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0834 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 334 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  66.17 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  66.47 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  58.26 
 
 		 324 aa  346  3e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.06 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  43.81 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  48.11 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  44.1 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 298 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  41.85 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.93 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  46.79 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 309 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 309 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.61 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  42.8 
 
 		 309 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.82 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  43.89 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  38.2 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  31.97 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  34.64 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  31.56 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  35.83 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 298 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  35.95 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  36.13 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  36.13 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  32.91 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  27.16 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  28.4 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  28.4 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  27.94 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  30 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  28.15 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  28.15 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  28.15 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  27.44 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  26.29 
 
 		 271 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  31.94 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  27.44 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  34.38 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  32.87 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  34.92 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  26.83 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  29.12 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  35.92 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  32.65 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  34.48 
 
 		 272 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  28.91 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 		 294 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 275 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  32.8 
 
 		 280 aa  52.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  25.17 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  27.91 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  31.61 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 		 279 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  33.15 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  32.31 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  34.33 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  30.17 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  28.99 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  28.99 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  28.26 
 
 		 233 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  29.51 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  33.59 
 
 		 276 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>