More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1099 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
311 aa  613  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  55.39 
 
 
309 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  55.39 
 
 
309 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  54.65 
 
 
309 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  47.1 
 
 
318 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  51.47 
 
 
313 aa  268  7e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  45.85 
 
 
307 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  52.85 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  46.69 
 
 
310 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  44.32 
 
 
298 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  44.32 
 
 
298 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 
298 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 
298 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  43.96 
 
 
298 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  43.96 
 
 
298 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  43.96 
 
 
298 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  43.22 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  40.2 
 
 
298 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
310 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  46.5 
 
 
318 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  42.29 
 
 
309 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 
317 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
309 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  42.48 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  38.13 
 
 
309 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  44.81 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  37.79 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 
309 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
311 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 
309 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  39.64 
 
 
313 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 
311 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
314 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  39.76 
 
 
316 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  32.56 
 
 
312 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  31.29 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  33.47 
 
 
326 aa  116  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  34.01 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  38.12 
 
 
294 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  35.75 
 
 
285 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  47.11 
 
 
285 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.72 
 
 
267 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  37.72 
 
 
290 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 
279 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  47.93 
 
 
282 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  47.93 
 
 
282 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  47.93 
 
 
282 aa  99  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35.03 
 
 
267 aa  98.6  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  35.59 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  48.76 
 
 
282 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  36.71 
 
 
276 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  44 
 
 
249 aa  95.9  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.31 
 
 
242 aa  95.5  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  44 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  41.46 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.88 
 
 
475 aa  95.1  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  44.14 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  40.48 
 
 
284 aa  94.7  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.8 
 
 
265 aa  94.4  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.73 
 
 
368 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 
296 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  46.43 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 
211 aa  93.6  4e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  44.19 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  47.75 
 
 
287 aa  93.6  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  41.96 
 
 
285 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  37.27 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 
260 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.24 
 
 
260 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.74 
 
 
216 aa  92  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  39.39 
 
 
276 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  42.59 
 
 
208 aa  91.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  46.36 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  39.2 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
287 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  35.8 
 
 
293 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  37.24 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>