More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0114 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  60 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  59.49 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  59.16 
 
 		 311 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  56.59 
 
 		 309 aa  358  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  58.06 
 
 		 310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  58.69 
 
 		 310 aa  355  7.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  56.86 
 
 		 318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  54.63 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  57 
 
 		 298 aa  343  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  55.73 
 
 		 310 aa  339  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  52.58 
 
 		 310 aa  338  8e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  57.24 
 
 		 309 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  56.11 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  56.11 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  56.11 
 
 		 309 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  56.23 
 
 		 309 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 		 309 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  54.79 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  53.33 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  55.12 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  52.68 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  50.69 
 
 		 316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  39.82 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  39.81 
 
 		 326 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  43.46 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  37.46 
 
 		 324 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  41.22 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  40.54 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  40.74 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  40.4 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  40.4 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  39.73 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 		 475 aa  96.3  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  36.25 
 
 		 275 aa  92.4  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.78 
 
 		 285 aa  92.4  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  44.74 
 
 		 280 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  35.44 
 
 		 290 aa  90.5  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  35.57 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  36.16 
 
 		 208 aa  89.4  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 		 254 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  44.35 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 		 282 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  41.04 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  40.3 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  41.13 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  41.32 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  41.32 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  32.7 
 
 		 285 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  41.32 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  39.68 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  38.51 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  38.89 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  37.33 
 
 		 254 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.02 
 
 		 233 aa  85.9  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  41.54 
 
 		 270 aa  85.9  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  36 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  41.27 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  37.89 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.34 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  42.73 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  34 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  41.07 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>