More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2778 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 313 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  56.71 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  55.37 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  55.37 
 
 		 309 aa  344  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  55.37 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  52.19 
 
 		 313 aa  325  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  50.17 
 
 		 307 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1099  phosphatidate cytidylyltransferase  52.57 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  48.64 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  48.64 
 
 		 298 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  246  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  48.3 
 
 		 298 aa  242  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1174  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0222837  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  40.73 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  43.28 
 
 		 298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  42.33 
 
 		 309 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  39.54 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.53 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.86 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  38.8 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  43.19 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0114  phosphatidate cytidylyltransferase  42.24 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  40.33 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834933  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0185  phosphatidate cytidylyltransferase  39.19 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.359155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  38 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0834  phosphatidate cytidylyltransferase  32.48 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1084  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 326 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00317494  normal  0.495362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0931  phosphatidate cytidylyltransferase  32.46 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  35.38 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0483  phosphatidate cytidylyltransferase  28.4 
 
 		 324 aa  119  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557769 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  42.97 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  38.07 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  37.12 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.24 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  39.07 
 
 		 208 aa  102  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.55 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  45.3 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.44 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 265 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.19 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.19 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.19 
 
 		 282 aa  99.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  46.03 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  37.41 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 		 280 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  40.74 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  34.33 
 
 		 273 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.25 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  33.91 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  36.88 
 
 		 276 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 285 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  41.46 
 
 		 264 aa  96.3  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.53 
 
 		 275 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  35.84 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.48 
 
 		 368 aa  95.9  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 271 aa  95.9  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  43.33 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  40.98 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  37.04 
 
 		 284 aa  94.4  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 		 268 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.84 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 		 262 aa  93.6  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  38.52 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  36.15 
 
 		 242 aa  93.6  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  42.06 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  33.78 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.78 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  42.61 
 
 		 254 aa  93.2  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  35.38 
 
 		 264 aa  93.2  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  42.22 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 264 aa  92.8  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  44.26 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  44.26 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>