More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0584 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
260 aa  498  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
261 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 
262 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  34.52 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.93 
 
 
280 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  43.12 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.02 
 
 
278 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
260 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
267 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
275 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
264 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  38.82 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  31.93 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
266 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.54 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  31.36 
 
 
290 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  38.86 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  38.37 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  52.71 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 
277 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  40.59 
 
 
271 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  53.68 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
267 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  48.23 
 
 
254 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  42.75 
 
 
265 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.96 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  41.43 
 
 
267 aa  108  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
271 aa  109  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  36.07 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 
286 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
267 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  46.21 
 
 
279 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  33.06 
 
 
264 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0611  phosphatidate cytidylyltransferase  48.19 
 
 
259 aa  105  6e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.621045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  28.02 
 
 
263 aa  105  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  44.85 
 
 
242 aa  105  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  37.57 
 
 
282 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  37.57 
 
 
282 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  37.57 
 
 
282 aa  105  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
313 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.71 
 
 
211 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  42.52 
 
 
280 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
336 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  29.93 
 
 
332 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  51.28 
 
 
293 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  29.06 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  47.2 
 
 
319 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  35.38 
 
 
264 aa  102  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  44.63 
 
 
285 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 
256 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
296 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.27 
 
 
279 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  42.98 
 
 
285 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  31.73 
 
 
712 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 
260 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
298 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  31.89 
 
 
260 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  35.68 
 
 
283 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  44.54 
 
 
298 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  44.63 
 
 
282 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  40.65 
 
 
260 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 
268 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00106784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  30.94 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
295 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  32 
 
 
282 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  36.46 
 
 
285 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
295 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  27.84 
 
 
261 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  44.63 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  39.86 
 
 
208 aa  99  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
318 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  38.32 
 
 
259 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  42.86 
 
 
298 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
298 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  42.86 
 
 
298 aa  99  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
298 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  39.42 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
298 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  40.8 
 
 
249 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  40.8 
 
 
285 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>