More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1403 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 254 aa  461  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  32.44 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.65 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  45.28 
 
 		 274 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  44.67 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.15 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.15 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  35.05 
 
 		 285 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  40.61 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  52.55 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40.94 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3512  phosphatidate cytidylyltransferase  45.83 
 
 		 336 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0503603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  38.04 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  34.96 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 		 275 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  34.8 
 
 		 271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.16 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  38.94 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.72 
 
 		 475 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  48.57 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  32.45 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  30.69 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  53.1 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  30.58 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 		 285 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  33.21 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 		 282 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  30.15 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  45.65 
 
 		 290 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  45.13 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  52.78 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  47.62 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  51.69 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  45.8 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  47.01 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  42.68 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000132658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2630  phosphatidate cytidylyltransferase  44.78 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000515592  normal  0.523786 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  47.26 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2897  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00110713  normal  0.164322 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  33.46 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.07 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1486  phosphatidate cytidylyltransferase  49.59 
 
 		 290 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00292599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  43.08 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 298 aa  105  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.29 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  51.67 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  48.68 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  36.96 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.5 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  38.3 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  42.58 
 
 		 284 aa  105  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  46.49 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  43.38 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  33.84 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  49.17 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.442492  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14961  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.338781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  41.96 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  48.65 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01364  predicted CDP-diglyceride synthase  45.61 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.861719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  42.45 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1455  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000205389  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01376  hypothetical protein  45.61 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.896621  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  45.61 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1144  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.200182  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>