More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0828 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
260 aa  511  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  86.15 
 
 
260 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  86.15 
 
 
260 aa  456  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  50.77 
 
 
263 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  50.58 
 
 
263 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
263 aa  258  9e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
263 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
263 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  48.85 
 
 
263 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.42 
 
 
264 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
263 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
263 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  50.38 
 
 
263 aa  249  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
265 aa  247  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  49.6 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  46.95 
 
 
264 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  45.42 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  42.64 
 
 
261 aa  211  7e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  43.89 
 
 
264 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  47.49 
 
 
265 aa  199  3e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  46.54 
 
 
264 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  42.8 
 
 
263 aa  193  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2434  phosphatidate cytidylyltransferase  42.26 
 
 
267 aa  174  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  38.43 
 
 
261 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.07 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.6 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  32.58 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  33.71 
 
 
262 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  46.04 
 
 
282 aa  128  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.75 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.306198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  42.75 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0262  CDP-diglyceride synthase  42.75 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0277384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  42.75 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.451367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  42.75 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  38.22 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  38.08 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  44.2 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  35.2 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.3 
 
 
280 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  43.48 
 
 
249 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  35.23 
 
 
269 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  43.48 
 
 
285 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
285 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.04 
 
 
285 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
287 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  43.94 
 
 
279 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 
285 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  43.51 
 
 
285 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  42.34 
 
 
282 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
296 aa  121  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
285 aa  121  9e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  43.23 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  46.03 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  42.77 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  48.76 
 
 
284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  41.33 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2703  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0203173  hitchhiker  0.00298681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
242 aa  119  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2810  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
285 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000490464  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2636  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
285 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000270352  normal  0.0751132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.13 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  38.41 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  44.62 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  45.86 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  47.24 
 
 
290 aa  116  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  45.04 
 
 
270 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  45.93 
 
 
280 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  28.21 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  51.3 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.36 
 
 
256 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  44.07 
 
 
246 aa  115  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  46.51 
 
 
280 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1353  phosphatidate cytidylyltransferase  43.85 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  36.59 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  51.35 
 
 
341 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  42.18 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  43.48 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  46.28 
 
 
270 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  47.93 
 
 
285 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  37.28 
 
 
267 aa  113  3e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  42.45 
 
 
282 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  36.69 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  47.11 
 
 
285 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  41.55 
 
 
279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  40.61 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>