More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1783 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
274 aa  530  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0479  phosphatidate cytidylyltransferase  36.17 
 
 
279 aa  148  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  43.79 
 
 
233 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  41.51 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  39.62 
 
 
252 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  41.88 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  45.28 
 
 
254 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  37.08 
 
 
268 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
280 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  31.7 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2751  phosphatidate cytidylyltransferase  45 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1490  phosphatidate cytidylyltransferase  44.76 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  35.02 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  35.45 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  37.31 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.73 
 
 
280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  35.52 
 
 
441 aa  115  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 
475 aa  115  6e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.37 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  48.78 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  47.37 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  40.4 
 
 
260 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  30.34 
 
 
263 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
272 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  31.48 
 
 
267 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
286 aa  112  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1962  phosphatidate cytidylyltransferase  42.17 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.616063  normal  0.0804364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3156  phosphatidate cytidylyltransferase  50.41 
 
 
285 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0354955  normal  0.0297791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  37.97 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  43.41 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  42.01 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  45.21 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  48.48 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  45.74 
 
 
282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3728  phosphatidate cytidylyltransferase  37.39 
 
 
248 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  42.97 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1492  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
275 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.199134  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  32.5 
 
 
256 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  40.62 
 
 
281 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  45.97 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 
267 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  48.09 
 
 
285 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  44.72 
 
 
282 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
265 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
281 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  44.72 
 
 
275 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 
261 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
281 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  46.34 
 
 
285 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
269 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  33.19 
 
 
339 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  40.88 
 
 
295 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  31.73 
 
 
263 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  31.5 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  27.96 
 
 
306 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  45.9 
 
 
269 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  31.87 
 
 
263 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1045  phosphatidate cytidylyltransferase  48.03 
 
 
276 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.447083  normal  0.0440857 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2422  phosphatidate cytidylyltransferase  32.72 
 
 
279 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.522142  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
268 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  48 
 
 
272 aa  105  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  29.48 
 
 
267 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  41.25 
 
 
259 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  31.95 
 
 
277 aa  105  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  46.34 
 
 
264 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  30.97 
 
 
258 aa  105  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
296 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  42.25 
 
 
262 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  36.13 
 
 
296 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  42.28 
 
 
264 aa  105  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0942  putative phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
205 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0168079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  43.83 
 
 
261 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  48.51 
 
 
287 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  29.48 
 
 
267 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
287 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
263 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  32.95 
 
 
265 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  32.3 
 
 
246 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 
272 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
263 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  30.63 
 
 
265 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  35.29 
 
 
276 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  29.87 
 
 
307 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  32.77 
 
 
289 aa  104  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  49.19 
 
 
285 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0244  CDP-diglyceride synthase  43.55 
 
 
285 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.384885  normal  0.739542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  43.9 
 
 
285 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  43.55 
 
 
285 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
271 aa  103  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>