More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0611 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0611  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
259 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.621045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  42.02 
 
 
261 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0584  phosphatidate cytidylyltransferase  44.31 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  40.7 
 
 
262 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  44.71 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  32.13 
 
 
278 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  36.62 
 
 
280 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
283 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0887  phosphatidate cytidylyltransferase  38.93 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000174513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2623  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
269 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000229401  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  33.11 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  36.06 
 
 
261 aa  125  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
260 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 
275 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  36.98 
 
 
271 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  33.8 
 
 
293 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  33.7 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  43.43 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
260 aa  119  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  49.29 
 
 
254 aa  118  7.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  33.68 
 
 
332 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  32.31 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
267 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  47.18 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  44.91 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  33.69 
 
 
267 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  44.37 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  36.7 
 
 
288 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  34.23 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.89 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  34.89 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.57 
 
 
277 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.55 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  36.03 
 
 
281 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  40.13 
 
 
263 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1424  phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
264 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.521758  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  40.68 
 
 
280 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  43.84 
 
 
291 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  49.25 
 
 
475 aa  105  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  44.12 
 
 
279 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
274 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
270 aa  105  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3431  phosphatidate cytidylyltransferase  34.55 
 
 
304 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  40.21 
 
 
242 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
252 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
293 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1532  phosphatidate cytidylyltransferase  44.83 
 
 
269 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.987058  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  35.71 
 
 
266 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
275 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2713  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
258 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0757456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
261 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  42.11 
 
 
295 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  43.18 
 
 
270 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  35.14 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1711  phosphatidate cytidylyltransferase  42.41 
 
 
269 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.978345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  29.64 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  29.64 
 
 
260 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.52 
 
 
281 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0690  dihydroneopterin aldolase  44.65 
 
 
287 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000502165 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 
270 aa  102  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.73 
 
 
271 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 
236 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  36.57 
 
 
273 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.44 
 
 
264 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.14 
 
 
281 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  40.12 
 
 
281 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
298 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  40.41 
 
 
216 aa  101  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  32.47 
 
 
307 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  43.51 
 
 
322 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  43.57 
 
 
290 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
276 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  39.6 
 
 
271 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
368 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  34.73 
 
 
271 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  39.55 
 
 
262 aa  99.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  38.57 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  39.04 
 
 
211 aa  99  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  43.75 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  40.51 
 
 
339 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2880  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
285 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000703616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  31.82 
 
 
269 aa  99  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  40.85 
 
 
302 aa  98.6  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  39.87 
 
 
289 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  47.41 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3083  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
309 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3005  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
309 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.427788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.98 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1288  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 
309 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117983  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  39.16 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  41.48 
 
 
284 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  41.26 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2114  phosphatidate cytidylyltransferase  45.76 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>